肿瘤抗原与免疫亚型分析用于膀胱癌mRNA疫苗的开发

被引量 : 0次 | 上传用户:stephenlyx
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的膀胱癌是泌尿系统中常见的恶性肿瘤,发病率与致死率逐年攀升,近些年随着精准医疗不断发展,肿瘤免疫治疗已成为继放疗、化疗、靶向治疗之后的新的研究热点。越来越多证据表明,肿瘤特异性抗原、免疫检查点分子以及肿瘤微环境与癌症发生发展密切相关。抗原可在一定程度上激活免疫系统克服肿瘤引起的免疫抑制状态,增强激活免疫功能,达到抗肿瘤治疗。本研究通过识别膀胱肿瘤的突变抗原及预后为癌症治疗性疫苗初步设计作出探索。此外,鉴定出膀胱癌的免疫表征相关分子分型,基于免疫微环境的状态,分析不同亚型肿瘤免疫相关特征,以便区分异质性队列中患者,选择合适的治疗群体。方法从TCGA和GEO数据库中获取基因表达谱和相应的随访数据,Imm Port数据库提取完整的免疫相关基因列表。通过c Biopotal数据库WES进行可视化和分析,基于TIMER中分析免疫细胞与肿瘤突变抗原的相关性。通过扩增,突变,预后以及免疫细胞浸润相关性逐步缩小潜在的肿瘤抗原范围,并通过实时定量PCR(q RT-PCR)进行验证筛出的抗原表达。GEPIA对突变及预后相关抗原进行生存分析,基于免疫相关表达谱采用无监督性一致性聚类分析免疫亚型,比较亚型之间免疫微环境,利用流形学习算法构建免疫景观以展示个体膀胱癌的免疫征象。WGCNA通过表达量聚类分析及免疫表型相关联。鉴定关键模块,以及不同模块之间在不同分型之间特征根基因比较、通路富集分析,最后比较模块与PCA相关性。结果根据分析得出3个预后相关可能成为m RNA疫苗治疗的潜在突变抗原(CYTH3、OSBPL6和EHBP1),q RT-PCR显示两种抗原在膀胱癌细胞系中呈显著高表达。此外,鉴定出膀胱癌患者分为两个免疫相关亚型,IS1和IS2,IS2患者的存活率高于IS1患者,分析不同亚型之间免疫微环境,IS1患者较IS2表现为免疫细胞浸润丰富状态,根据比较不同免疫分型免疫治疗指标,其中免疫检查点和免疫原性细胞死亡调节因子的表达均存在显著差异。进一步利用免疫表达图谱揭示了患者个体的免疫状态具有免疫异质性。此外、识别出14个免疫基因相关模块。IS1特征根基因显著高于IS2,蓝色模块与PCA具有显著相关性。结论本研究初步鉴定了CYTH3、OSBPL6是设计抗膀胱m RNA疫苗初步探索的潜在抗原,根据免疫微环境特征相关分析,IS1型患者是更适合接种免疫治疗性肿瘤疫苗的人群。同时为膀胱癌的靶向治疗提供潜在靶点。图19参45
其他文献
瑶族在历史上长期处于迁徙流离的边缘生存状态,民族兴衰的历史文化背景影响着民族审美心理结构的形成,历史的发展决定了心理背景的变化,民族审美心理和服饰文化也随之发生变化。白裤瑶作为瑶族支系中民族文化保留最完整的一个民族,其服饰色彩作为一种抽象语言,无声地表达着白裤瑶背后保留的民族文化。文中通过阅读相关文献对白裤瑶服饰及其色彩进行调研,并对调研结果进行一定的分类研究。对白裤瑶服饰的色彩分析可以使读者从色
期刊
报纸
<正>"工匠精神"是这一时代的热词,普遍适用在各个工作领域。微课是适应数字时代新的学习需求的产物,其"短小精悍"的特点正在受到人们的广泛关注,并得到快速发展。要设计制作出优质的微课资源,离不开"工匠精神"。"工匠精神"从纪录片到媒体报道,到写进《政府报告》,成为这一时代的热词。"工匠精神"是指工匠对自己的产品精雕细琢,精益求精的精神理念。有人总结为,从容独立、踏实务实;摒弃浮躁、宁静致远;精致精细
期刊
<正>提升补能效率是新能源车技术发展的重点之一,800 V高压快充平台渐行渐近。可以预见,800 V高电压平台风口已来,并且将触发更多产业新机遇。提升补能效率是新能源车技术发展的重点之一,800 V高压快充平台渐行渐近。续驶能力及补能效率是部分消费者在购买新能源车时的顾虑。当前,大部分电动车的续驶里程在700 km以内,在电池能量密度短期内提高程度有限的前提下,众厂商纷纷将目光投向了补能效率上。目
期刊
目的 观察超促排卵后体外受精对小鼠囊胚发育的影响。方法 根据体外受精的关键步骤,包括超促排卵、体外受精和体外胚胎培养,设置自然交配组(n=8)、超促排自然交配组(n=8)、体外培养组(n=5)、超促排体外培养组(n=6)和体外受精组(n=15)。根据Gardner分级,观察各组E3.5的囊胚发育情况。比较超促排体外培养组和体外受精组Ⅴ级囊胚的孵出面积之比,分析体外受精组囊胚移植后的胎鼠妊娠率。统计
期刊
<正> 本文概述了近期Duralink HTS的工业应用和进一步的开发。 Duralink HTS有两种主要应用: 1.用作NR、IR、NBR及它们的共混胶的二次硫化稳定剂; 2.在NR、IR、SBR、NBR及其共混胶与镀黄铜钢丝帘线进行粘接时作为粘接添加剂。
期刊
基因编辑技术可对生物体的遗传物质进行精准修饰和定向改造,是当前生命科学领域最受瞩目的颠覆性技术之一,也是农牧业生物育种中的关键核心技术。近年来,随着我国对高产优质饲草的需求量持续增加,亟须培育具有自主知识产权的优质饲草品种。该文简要概述了基因编辑技术的发展及其在农业育种中的应用,总结了禾本科和豆科饲草的基因组编辑研究进展,展望了未来利用基因组编辑开展饲草分子设计育种的发展方向。
期刊
在长期发展过程中,工农业废弃物以及垃圾对水环境造成了严重影响,只有加强检测才能够充分了解水环境中的重金属,因此本文利用调查法、文献资料法等方法对水环境检测中重金属检测技术的应用进行了研究与探讨。探究结果表明,水环境重金属污染具有污染源众多、恢复难度大等特点。所以应灵活应用比色传感器检测、荧光传感器检测、电化学传感器检测、电感耦合等离子体质谱法等技术检测水环境中的重金属,并通过控制污染源头、控制底泥
期刊
在对化工机械设备防腐蚀能力进行提升管控的过程中,工程师以及相关设计人员应当对当前设备的运行工况、运行环境进行分析评估,对当前设备在运行期间所存在的化学腐蚀类型进行分析考量,结合定向化、精益化的管控思想、管控思路,提高机械设备的防腐性能,提升设备的运行效率。
期刊
非洲猪瘟是由非洲猪瘟病毒引起的一种烈性传染病性疾病,在家猪和欧亚野猪中具有极高的致死率。在过去的十年里,非洲猪瘟在欧洲、亚洲和美洲等国家中相继出现,目前已广泛分布于全球各地。在此背景下,本文综述了非洲猪瘟病毒的病原学、流行病学、诊断及防控措施等方面的最新研究进展,以期为非洲猪瘟的防控提供理论参考。
期刊