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目的通过对确诊为青少年肌阵挛癫痫(juvenile myoclonic epilepsy,JME)的患者进行全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES),明确JME患者的基因诊断,为JME的发病机制及诊疗提供依据。方法对2015年6月-2016年12月就诊于第四军医大学西京医院神经内科癫痫专科门诊的确诊为JME的29例患者进行WES,通过与数据库比对及生物信息学分析初步筛选基因突变位点,对该位点进行一代验证和相关亲属验证,依据2015年美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)联合分子病理学学会发布的《序列变异解读标准和指南》筛选出致病或可能致病的突变,明确这些JME患者的基因诊断,并结合临床用药疗效分析不同变异的治疗效果。结果在29例行WES的JME患者中,发现23例患者存在致病或可能致病的基因突变,共检出21个突变位点(其中3例患者为同一位点突变),包括20个单基因错义突变和1个单基因移码突变。在20个单基因错义突变中,CLCN2突变位点6个:c.1834G>Ap.R612C, c.1991A>T p.E664V, c.1141C>G p.P381A, c.2006G>Ap.A669V,c.1141G>C p.P381A,c.1705G>A p.G569S; CACNA1H突变位点 3 个:c.1735G>A p.D579N,c.5468G>A p.R1823H,c.3646G>A p.D1216N; CHD2突变位点 2 个:c.927C>Gp.I309M,c.2291A>Cp.H764P;以下突变位点各 1 个:SCN2Ac.1571G>A p.R524Q, LAMC3 c.1675A>G p.I559V, GRIN2A c.2636A>G p.K879R, EFHC1с.268A>G p.M90V, CHRNA2 c.1073G>T p.S358I, GABRA1 c.116C>T p.T39I, CACNB4 c.1550C>Tp.R517Q,KCNT1 c.3317G>Ap.R1106Q, CACNA1D c.2206A>Gp.M736V)。1个单基因移码突变为DEPDC5c.3225_c.3226insG p.V1076Gfs*85。发现6例患者基因突变的位点尚未见既往文献报道,包括5例单基因错义突变(CLCN2 c.1834G>Aр.R612C, EFHC1 c.268A>G p.M90V, GABRA1 c.116C>T p.T39I, CACNB4 c.1550C>T p.R517Q,CHD2c.2291A>C p.H764P)和 1 例单基因移码突变(DEPDC5 c.3225_c.3226insGp.V1076Gfs*85),5例单基因错义突变经软件预测结果显示突变导致的蛋白质翻译的变化对蛋白功能均有影响,1例单基因移码突变因导致DEPDC5基因编码的蛋白从第1076位氨基酸开始算起,后面再翻译85个氨基酸即终止,且这85个氨基酸是移码的,序列和原来的序列完全不同,因此该位点突变风险较高,致病可能性较大。另有8例患者的突变基因为目前研究报道中与其他类型癫痫相关的基因,尚未见这些基因与JME发病相关的报道。6例CLCN2基因突变的患者中,3例为肌阵挛发作(myoclonic seizures,MS)伴全面强直-阵挛发作(generalized tonic-clonic seizures,GTCS),2 例为 MS 伴 GTCS 和失神发作(absence seizures,AS),1例患者为单纯MS。这6例患者中,有4例患者接受丙戊酸治疗,3例总发作减少100%,1例总发作减少75%-99%; 2例患者接受左乙拉西坦治疗,总发作减少均在50%-74%。发现5例患者存在CACNA1H基因突变,其发作类型均为MS伴GTCS,其中有2例患者接受丙戊酸单药治疗,3例接受双药联合治疗,所有患者的GTCS均减少100%,MS减少均在75%-99%,其中有2例患者曾在MS未得到控制时尝试减药,但均在减药过程中(未完全停药)出现GTCS。结论本研究在29例行WES的JME患者中发现23例患者存在致病或可能致病的基因突变,其中6例为新发现的突变,突变位点尚未见相关文献报道。另有8例患者的突变基因为目前研究报道的与其他类型癫痫(非JME)相关的基因,推测JME可能和其他类型癫痫拥有共同的基因基础。CACNA1H突变的JME患者的表型可能多为MS合并GTCS,抗癫痫治疗后GTCS较MS易得到控制,同时该类患者须慎重减停药。总之,WES为JME患者的基因诊断提供了线索,同时也为该病的发病机制及精准治疗提供了一定的依据。