当前，科技创新已经成为推动人类经济社会发展的关键因素，正在引领时代潮流。2009年，北京市提出要把北京建设成为中国创新发展的核心引领区和具有全球影响力的科技创新中心，国务院随后也批复了中关村作为全国首个自主创新示范区，科技创新已成为北京市转变经济发展方式的重要引擎、参与国际竞争的客观保障以及建设有中国特色创新型世界城市的核心动力。科技创新的公共性、外部性、不确定性以及战略性等特殊属性，使得政府财政的介入成为必要，而财政支出是促使科技创新动力形成的关键因素，特别是对于北京等以科技创新作为未来经济社会发展核心动力的战略性城市，财政支出激励对于科技创新的引导作用尤为重要。本文主要探讨财政支出对科技创新的激励效应，文中采用理论分析与实证分析相结合的方法对财政支出激励与科技创新之间的互动关系进行了研究，拟在借助前人研究成果的基础上，仔细梳理财政支出激励科技创新的理论依据，深入探索财政支出激励科技创新的作用机制，并立足于北京市的实际情况，对财政支出激励科技创新的实际效果进行综合分析和实证考察，以期能够清晰认识到财政支出激励科技创新的机制机理和作用效果，最后综合全文从财政支出激励的导向作用、服务支撑和资金使用效率等角度出发为北京市财政支出激励科技创新的发展提出一些建议。