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本研究选取均匀分布于水稻12条染色体上的38对SSR引物和24对SNP引物对24份籼稻地方品种、32份籼型不育系和45份籼型恢复系共101份水稻材料进行遗传多样性分析,分析三者遗传多样性的差异,进而为水稻杂种优势利用或杂交育种选育提供重要的理论依据。主要研究结果如下：1、在38个SSR位点上共检测到了206个等位基因,平均每对SSR标记检测到了5.4个等位基因。在地方品种、不育系和恢复系中分别检测到了135、128和148个等位基因,平均每对SSR引物检测到的等位基因数分别为3.6、3.4和