油梨(Persea americana Mill.)属于樟科鳄梨属,是生长在热带、亚热带地区的常绿植物,世界百科全书将其列为最富有营养的水果。油梨有“森林黄油”的美称,是世界上热带、亚热带著名的水果之一。根据油梨原生生长的自然生态环境,油梨被划分为3个广为认可的品系:墨西哥系、西印度系和危地马拉系及其杂种品系。当前用于商业化生产的油梨品种并不多,油梨规模化商业生产多用无性繁殖。在世界上大多数适种地区包括东南亚地区分布的油梨多为实生种子树,经过上百年的引种种植,形成油梨在地方种类上出现的遗传变异数量繁多,形态及各种性状丰富的多样性,在其中有许多种质表观出优良的性状在油梨选育种具有很大的利用潜力。另外,由于油梨具有雌雄异熟的特性及长时间的种子繁育,油梨3大品系间杂合程度高,种质难以界定,直接影响种质资源的开发和利用。本研究基于对油梨转录组的分析,开发SSR分子标记,将中国(海南、广西、贵州)、美国、缅甸、老挝、印度尼西亚、越南等各地收集的油梨种质资源纳入本次实验进行分析,以了解油梨品种间的亲缘关系及各地油梨种质资源之间的遗传多样性,对油梨种质资源和现有商业品种进行快速准确的鉴定、油梨遗传资源的开发及利用以及选择育种亲本具有非常重要的意义。1)从‘Hass’和‘Fuerte’的转录组数据中检索SSR序列,分别获得6 449个和6 312个。其中,二碱基重复类型的数量最多,分别占‘Hass’和‘Fuerte’SSR总数的48.44%和48.32%,AG/CT为出现频率最高的核苷酸重复基元,在‘Hass’中共2 477个(38.41%),在‘Fuerte’中共2 478个(39.26%);各核苷酸重复类型在5次重复中出现的次数最多,‘Hass’品种中为1 539次,占比为23.86%,在‘Fuert e’中为1 543次(24.45%);两个品种最优势的10个微卫星类型相同。2)使用Primer 3.0软件为两个油梨品种转录组中得到的SSR序列进行批量设计引物,分别成功为‘Hass’、‘Fuerte’的SSR序列设计出13 686、13 398对引物。从中分别随机选择25对SSR引物并以8份油梨种质资源的DNA样品为模板进行引物的有效性检测,观察扩增结果分别得到了11和10对多态性较高的引物,多态性引物的比率分别为44%和40%。从‘Fuerte’转录组挑选的100对SSR引物进行有效性验证的结果显示:在挑选的100对SSR引物中,其中有89对能够扩增出条带,其中的30对具有良好的多态性特征。30对引物对96份油梨种质资源的扩增实验中,总共扩增出157条谱带,其中的156条谱带具有多态性,多态率为99.36%。每对引物对油梨种质扩增条带的数目分布在2~11条范围之间,平均每对引物可以扩增产生5.23个多态性片段。3)多态性信息含量(PIC)值的大小反映是基因型多态性的程度。30个位点多态信息含量(PIC)的平均值为0.424,变化范围为0.097(Av-76)~0.750(Av-32),根据PIC值的高低,30对引物的排序为:AV-32>AV-08>AV-20>AV-51>AV-62>AV-31>AV-45>AV-40>AV-43>AV-87>AV-07>AV-01>AV-77>AV-82>AV-92>AV-63>AV-90>AV-54>AV-16>AV-78>AV-85>AV-89>AV-24>AV-37>AV-56>AV-53>AV-91>AV-81>AV-86>AV-76。4)使用筛选产生的30对多态性引物对96份油梨种质资源进行遗传多样性分析,得到的结果为:各SSR位点的有效性等位基因(Ne)的平均值为2.069,范围由最低的1.111(AV-76)到最高4.646(AV-32),香浓多样性指数(I)的平均值为0.847,值域范围在0.240到1.570之间;观察杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的平均值分别为0.389和0.475,数值的变化范围分别在0.042~0.927和0.101~0.789之间,其中有70%位点的期望杂合度大于观测杂合度。5)由UPGMA聚类和PCA主成分分析结果较一致,表明油梨种质群体的进化与地理分布有一定的关系。