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目的比较自身免疫性疾病病人与非免疫性疾病病人的乙型肝炎病毒（Hepatitis B virus，HBV）感染情况。方法回顾2000～2012年就诊于吉林大学第一医院、黑龙江省医院、杭州市第六人民医院的四种自身免疫性疾病病人及三种非免疫性疾病病人的乙肝标志物检查结果及人口学资料。自身免疫性疾病包括自身免疫性肝炎（AIH）、原发性胆汁性肝硬化（PBC）、系统性红斑狼疮（SLE）、溃疡性结肠炎（UC），其中自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化以肝脏为靶器官；非免疫性疾病包括阑尾炎、腹股沟疝、分娩女性。卡方检验自身免疫性疾病组（自免组）与非免疫性疾病组（对照组）乙肝表面抗原（Hepatitis B surface antigen，HBsAg）阳性率是否存在性别或年龄差异及两组间核心抗体阳性率是否存在差异。多因素的分析采用logistic回归分析。结果自免组HBsAg阳性率较对照组HBsAg阳性率低，(2.24VS4.58%, P=0.0014)。其中肝脏相关自身免疫性疾病AIH组、PBC组与对照组比较HBsAg阳性率低，均存在统计学差异(0.83%, P=0.006；1.02%, P=0.004)。非肝脏自身免疫性疾病SLE组、UC组与对照组比较，HBsAg阳性率无统计学差异。自免组乙肝核心抗体阳性率均对照组高，有统计学差异(42.13%vs21.60%, P=7.62E-24)。结论自免组HBsAg阳性率低于对照组HBsAg阳性率，而自免组核心抗体阳性率却高于对照组核心抗体阳性率，这可能暗示着患有自身免疫性疾病的病人对HBV清除能力增强，肝脏自身免疫疾病病人表现尤其明显。