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目前,肿瘤是一种威胁人类健康的顽疾,其发病率高、致死率高、预后复发率高。现有研究发现,基因表达的失调与肿瘤的发生、发展关系密切。组蛋白修饰,如甲基化、乙酰化等,是调控基因转录重要方式之一。近年来,以组蛋白去乙酰化酶为靶点的肿瘤抑制剂是当前研究热点之一。目前,组蛋白去乙酰化酶抑制剂的抗肿瘤分子机制及下游基因调控网络尚不清楚。因此,本研究主要以组蛋白去乙酰化酶抑制剂(HDACi)现有研究为基础,通过分析、整合多种数据库资源,初步构建出基于组蛋白去乙酰化酶抑制剂调控下的肿瘤基因表达调控网络,从而为临床肿瘤分子靶向治疗提供新的依据。方法:1、通过对HDACi影响的肿瘤进程相关基因的文献数据检索,利用DIVID数据库、STRING数据库、Cytocaspe软件、Tfact转录因子数据库,对文献检索结果挖掘,构建基因编码蛋白间反应的网络图和最显著功能关联模块,同时对模块中的转录因子进行数据挖掘;2、通过对SAHA影响的肿瘤GEO表达谱数据的挖掘,利用BRB-array Tool软件、DIVID数据库、STRING数据库、Cytocaspe软件,对SAHA影响的肿瘤进程相关差异表达基因,构建基因编码的蛋白间反应的网络图和显著功能关联模块;3、SAHA对QGY-7701细胞基因表达影响的Real-time PCR实验验证。结果:1、通过对文献检索数据挖掘,得到HDACi影响的肿瘤进程相关基因的GO功能注释及KEGG路径,以及6个显著功能关联模块和转录因子;2、通过对基因芯片数据挖掘,得到SAHA影响的肿瘤进程相关基因的GO功能注释及KEGG路径,以及4个差异表达基因的显著功能关联模块;3、SAHA的验证实验,初步证明SAHA可能通过调控模块影响肿瘤细胞的发生发展。结论:1、通过GO功能注释和KEGG富集分析,HDACi可调控多个肿瘤相关基因表达和癌症信号通路(如TP53信号通路),抑制肿瘤细胞的增殖与分化。2、受HDACi调控的肿瘤进程相关基因可形成调控网络,协同抑制肿瘤的发生发展。3、HDAC3等6个显著功能模块,尤其是含转录因子的功能模块,可能在HDACi抑制肿瘤发生发展的调控中起到重要作用。4、受HDACi调控的转录因子(TP53、MYC、SP1、JUN等)及其相关通路,可能成为肿瘤治疗的重要靶点。5、HDACi可通过降低BRCA1、BARD1和RAD50表达,抑制DNA损伤修复,从而抑制肿瘤细胞增殖。