毛细管电泳法筛选克伦特罗的核酸适配体

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核酸适配体(Aptamer)是指通过指数富集配体系统进化技术(SELEX)从随机寡核苷酸文库中筛选得到的高亲和性与特异性的寡核苷酸序列。毛细管电泳(CE)技术具有分离效率高、分析速度快、实验成本低、样品用量少、分离模式多的优势。CE-SELEX技术将CE技术用于SELEX中快速分离靶标-核酸复合物的筛选过程,继承了CE的优点,提高了SELEX的筛选效率。本文以克伦特罗为靶标建立了筛选小分子靶标核酸适配体的CE-SELEX方法,并筛选得到具有一定亲和力的克伦特罗的核酸适配体。论文分为五部分:一、介绍了Aptamer的概念、SELEX技术原理,综述了小分子核酸适配体筛选方法的研究进展。介绍了毛细管电泳特点、分析模式和CE-SELEX的优点以及论文的研究内容、研究意义。二、建立了克伦特罗的毛细管电泳分析方法,并对克伦特罗与ssDNA和80mer的随机寡核苷酸文库的相互作用进行了毛细管电泳表征,证明两者之间存在相互作用。三、利用毛细管电泳法和荧光实时定量PCR技术(Q-PCR)对筛选过程中的PCR结果进行表征,优化了PCR过程的退火温度和循环数,优化了制备单链次级库的不对称PCR的引物比例。四、将80 mer的随机寡核苷酸文库与靶标混合,收集复合物并进行PCR扩增,再通过不对称PCR制备单链次级库。利用毛细管电泳技术进行了4轮SELEX筛选,并对每轮次级库进行了亲和力表征。五、将筛选的13条ssDNA测序。用DNAMAN软件对它们进行二级结构模拟分析,选择亲和力较高的适配体c12测定了其与克罗特结合的解离常数。
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