海洋真菌是海洋微生物的重要组成部分,参与海洋生态系统的物质循环、能量流动和信息传递,维持海洋生态系统的平衡与稳定。东印度洋是全球碳循环的重要组成部分,但对该海域的浮游生物群落结构和多样性研究还有很大空白。本研究选择赤道东印度洋及其以北的开放海域作为研究对象,主要对5个不同采样断面共22个采样站位进行多深度的水样采集工作,测定该海域的温度、盐度、溶解氧、七项营养盐等环境参数,分析对比了不同深度、断面和含氧环境下浮游真菌的丰度和多样性特征及其与环境因子的关系。在所研究海域内,物理性环境因子表现出明显的地理差异,部分营养盐浓度呈现随深度变化的特征。此外,孟加拉湾海域溶解氧含量整体低于其他海域,且与大洋普遍低氧环境相比,该海域的低氧水层厚度更大。研究海域的浮游真菌丰度与温度、溶解氧、叶绿素a和亚硝酸盐浓度呈现显著正相关关系,与密度和活性磷酸盐浓度呈显著负相关。浮游真菌丰度在各站位和各深度之间差异较大,非低氧环境的浮游真菌丰度高于低氧环境。在本文对浮游真菌多样性的研究中,共注释到浮游真菌11门38纲86目172科257属。在门水平,Ascomycota占有绝对优势;在属水平,相对丰度最高的为Alternaria。该海域的浮游真菌物种分布差异在不同站位和不同深度间均较大,某些站位的物种分布与其他站位截然不同。低氧环境所特有的ASVs呈现出随深度的分布特点,各深度间基本不存在共有ASVs。溶解氧和温度是调控浮游真菌群落ASV组成的主要环境因子。本研究获得了东印度洋开放海域浮游真菌丰度及多样性分布情况,丰富了该海域浮游真菌的相关研究,有助于全球海洋真菌分布体系的完善。