土壤微生物作为湿地生态系统的重要组成和功能组分，在湿地生物地球化学循环过程中具有重要作用。乌梁素海主要受河套灌区农业退水的影响，其富营养化进程逐年加剧，引起湿地生态系统结构和功能发生变化。本论文提出如下假说:湖泊富营养化导致的湿地退化可能会使沉积物及土壤中的细菌群落对此作出响应，并影响乌梁素海湖滨湿地细菌群落的陆向分布特征。研究以乌梁素海湖滨湿地陆向分布的4个样点为研究对象，应用变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术，分析和比较了湖滨湿地细菌群落结构多样性变化和差异，采用典型对应分析(CCA)探讨了富营养化湖泊湿地基质条件对细菌群落结构的影响及主要驱动因子。　　研究结果表明，在湖泊（芦苇）水体沉积物→湖滨（芦苇）沼泽沉积物→湖滨（碱蓬）盐碱化土壤→湖岸上（白刺）荒漠化土壤的陆向分布上，各样点细菌群落结构发生显著变化，细菌多样性呈逐渐降低的趋势;过渡带主要存在3大细菌类群，分属于变形菌门(78.6％)、酸杆菌门(7.1％)、拟杆菌门(14.3％)，优势类群为变形菌门。变形菌门主要包括了5个亚群，其中ε变形菌纲为优势亚群;湖滨带湿地沉积物及土壤样品中发现多种与功能菌相似性极高的菌种菌群，特别是在碳、氮、硫的循环及污染物降解中起着重要作用的细菌种类，推测这些功能菌的存在是对湖泊富营养化的响应;分析了基质因子对细菌群落结构组成及多样性的影响，发现富营养化相关基质条件对细菌群落结构变化特别是优势菌群的影响最大，且主要驱动因子为铵态氮、总氮、有机碳、以及水溶盐总量、氯离子、钾离子。这为研究富营养化湖滨湿地的细菌结构多样性及空间异质性提供了科学依据。