目前肿瘤患者的常规治疗主要依赖非个体化的手术切除、放化疗、靶向药物治疗等手段,但这些常规手段存在治疗不彻底、副作用大等一系列问题。近期研究表明,通过肿瘤患者自身的免疫系统靶向患者肿瘤细胞进行肿瘤免疫治疗的方法,即个体化肿瘤新抗原治疗,在黑色素瘤、乳腺癌中具有较好疗效。新抗原,作为肿瘤患者免疫治疗的特异靶标,是由患者肿瘤基因组特异突变产生。根据这一治疗策略,在众多可能区分肿瘤和正常组织的抗原中,准确高效地选择预期疗效较好的肿瘤新抗原尤为关键。本研究基于转录组测序技术和质谱技术,建立了个体化肿瘤新抗原发现方法。在发现方法中,使用转录组测序技术对肿瘤新抗原特征和肽段表达量进行提取,使用质谱技术分析主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)结合肽段。两种技术联合分析,以降低预测结果的假阳性。本研究针对提取的8个肿瘤新抗原特征,使用支持向量机(Support Vector Machine,SVM)构建肿瘤新抗原分类模型,以预测肿瘤新抗原是否具有免疫原性。最后,使用肝癌细胞系来测试本研究建立的个体化肿瘤新抗原发现方法,发现1个候选肿瘤新抗原,且候选肿瘤新抗原与血管生成有关。综上所述,本研究构建的发现方法可以帮助筛选候选肿瘤新抗原,降低整体结果的假阳性。同时,希望本研究对肿瘤新抗原免疫治疗、肿瘤标志物发现等领域起到一定的促进作用。