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目的绘制帕金森病(Parkinson’s disease, PD)患者,以及特发性震颤患者(essential tremor,ET)、多系统萎缩患者(Multiple system atrophy,MSA)、头痛对照组脑脊液蛋白质表达谱,并分别进行比较,寻找差异蛋白质点;确定PD的疾病特异性蛋白(disease-specific proteins,DSPs),探寻PD的生物标志物。方法采用双向凝胶电泳(2-DE)技术,以固相pH梯度等电聚焦(IPG-IEF)为第一向,垂直平板十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)为第二向分离蛋白质;用银染法对电泳后凝胶染色;凝胶图像扫描并用Pdquest软件进行图像分析,寻找有意义的差异蛋白点;利用MALDI-TOF-MS技术对差异蛋白点进行鉴定,分析其意义;采用ELLISA对其中差异显著蛋白进行定性和定量,验证质谱结果。结果①获得PD患者,以及ET患者、头痛患者、MSA患者各组脑脊液的2D-PAGE图谱;②通过比较确定了六个有意义的差异蛋白点,经鉴定分别为泛素连接酶(fubiquitin protein ligase,E3),载脂蛋白E (Apolipoprotein E,Apo-E),NADH-泛醌氧化还原酶ASHI亚单位(NADH-ubiquinone oxidoreductase ASHI subunit),胶质原纤维酸性蛋白(glial fibrillary acidic protein,GFAP),蛋白(质)酪氨酸磷酸酶1B (Protein-tyrosine phosphatase 1B,PTP-1B),载脂蛋白A I(Apolipoprotein A-I precursor,Apo-A1)。其中E3、ApoE、NADH-泛醌氧化还原酶ASHI亚单位在PD、MSA患者组相对于ET、头痛组下调,而后三个蛋白质点在PD组相对于MSA、ET和头痛组上调。③采用ELISA法对Apo-E进行了验证,结果与蛋白质组学结果一致。结论PD患者组脑脊液2D-PAGE图谱与头痛、ET、MSA患者对照组脑脊液2D-PAGE图谱之间存在差异;共鉴定出六个差异蛋白,这些蛋白主要涉及氧化应激、神经营养和修复、蛋白降解等,与PD关系密切,有可能是帕金森病的DSPs,并有可能成为PD诊断的分子标志物;用ELISA法对PD、头痛组、ET及MSA脑脊液中Apo-E进行定性和半定量,结果与蛋白质组学结果一致,表明蛋白质组学方法可行、结果可信。