青鱼是我国淡水养殖的四大主要鱼类之一,也是水产养殖的重要物种。随着集约化养殖的发展,青鱼的养殖环境和健康状态越来越受到人们的关注,同时,肠道健康及功能与其生长发育紧密相关。因此,在本研究中,我们使用组织学半定量系统对养殖青鱼的健康状况进行了评估,并使用组织学、酶活检测和RNA-seq测序技术对青鱼前肠和后肠在消化吸收和免疫机制上的差异分工进行了研究。具体的研究结果如下:1.组织学评估养殖青鱼的健康状况养殖状态下,鱼类的健康状态已经成为人们日益关注的问题。在本研究中,我们使用Bernet等人提出的组织学半定量系统评估了养殖条件下青鱼的健康状况。对青鱼的鳃、肝、脾和肠进行固定和脱水并使用标准技术制作组织切片。根据Zimmerli等人提出的评分方案计算各组织的器官指数,并对组织变化的严重程度进行分类。结果表明:青鱼的鳃、肝和脾的状况良好,处于Ⅰ级和Ⅱ级变化,肠道是最受影响的器官,达到Ⅲ级变化,在肠的组织学分析中发现肠粘膜上皮细胞增生和固有层易碎和坏死。青鱼的Fulton状态指数(Fulton’s Conditional factor,CF)介于1.45～2.94之间,均值为1.52;肝体指数(Hepatic somatic index,HSI)介于0.29～0.93之间,均值为0.58,表明被检测的青鱼状态良好。2.青鱼不同肠段组织结构的差异及消化酶与抗氧化能力的分布研究我们使用组织学和酶活检测的方法分析研究了青鱼不同肠段的组织结构差异及消化酶和抗氧化能力的分布,结果表明青鱼前肠的肠绒毛高度,黏膜厚度,肌层厚度和肠绒毛纵截面积均显著高于后肠(P<0.05),但是,青鱼前肠的隐窝深度和杯状细胞数目显著低于后肠(P<0.05)。同时,其消化酶和抗氧化能力在青鱼的前肠和后肠中也存在显著的差异,前肠淀粉酶、脂肪酶和胰蛋白酶的活性显著高于后肠(P<0.05),与消化酶活性的分布不同,后肠中超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)、谷胱甘肽还原酶(Glutathione reductase,GR)、过氧化氢酶(Catalase,CAT))活性和总抗氧化能力(Total antioxidant capacity,T-AOC)含量显著高于前肠(P<0.05)。该结果表明青鱼的前肠可能是其消化吸收营养物质的主要部位,而后肠在抵御机体氧化损伤、抗应激和保护肠道健康中起着关键的作用。3.青鱼前肠和后肠差异表达基因的转录组分析。鱼的肠道不仅起着营养吸收的作用,而且也是抵御病原感染的重要免疫屏障。这种功能多样性分布在肠的不同区域。为了探讨青鱼不同肠段的功能分化机制,我们将青鱼的前肠转录组与后肠转录组进行比较。从三个前肠个后肠的RNA文库中,我们获得了3.29×10~8个raw reads、48.19 G的clean reads和48061个unigenes。我们在前肠和后肠中共发现了1761个差异表达基因(DEGs)。在所有DEGs中,有861个显著上调,950个显著下调,Gene Ontology(GO)and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)分析表明前肠富集了更多与代谢和消化吸收相关的基因,后肠富集了更多与免疫相关的基因。