目的:　　调查中国中部大、中型湖库和长江干流地表水微生物污染状况,为我国地表水环境质量标准的修订提供基础数据。　　方法:　　于2010年6月至2010年8月采集中国中部12个大、中型湖泊、水库的60份地表水样和长江干流的12份地表水水样,5种指示菌(细菌总数、总大肠菌群、耐热大肠菌群、大肠埃希氏菌和肠球菌)采用滤膜法定量检测,4种致病菌(大肠杆菌O157、沙门氏菌、弧菌和志贺氏菌)浓集后选择培养,用血清凝集实验初筛后用色谱或PCR方法鉴定。　　结果:　　1.83.3％的湖库、长江干流中下游地表水耐热大肠菌群的水平达到或好于《中华人民共和国地表水环境质量标准》(GB3838-2002)Ⅲ类水质微生物标准。　　2.细菌总数、总大肠菌群、耐热大肠菌群、大肠埃希氏菌和肠球菌的检出范围为3.0×10～2.25×104(CFU/mL)、1.0×103～5.65×105(CFU/L)、0～5.0×104(CFU/L)、0～2.05×104(CFU/100mL)、0～2.0×103(CFU/100mL),检出率为100%、100%、61.1%、48.6%、22.2%。　　3.耐热大肠菌群数分别与总大肠菌群数、大肠埃希氏菌数和肠球菌数呈显著正相关(r=0.429,0.536,0.436)。　　4.仅长江干流的重庆岸边水样呈现弧菌阳性。　　结论:　　中国中部地表水微生物污染总体而言没有超出地表水Ⅲ类水质标准;耐热大肠菌群用作水质微生物污染的指示菌是适宜的。