资源分配问题在管理科学中应用广泛。众所周知,数据包络分析方法(DEA)是评价相对效率的一种有效方法,只需要决策单元原始的投入产出数据,不需要具体的生产函数的形式,因此很好地避免各种主观因素的影响。较之其他评价方法,DEA方法在处理多输入多输出效率评价问题方面的优势十分显著。然而资源分配的目标值通常具有多维性,比如作为一个银行企业来说,它既要达到利润最大化的经济目标,还要追求资源不过度浪费。目前研究学者主要考虑效率准则,或是基于公平准则研究决策单元之间的资源分配,却忽略了决策单元内部的资源配置,导致一定程度上的资源浪费。因此,本文主要采用数学建模、博弈分析与对比分析的方法,在现有文献对并行系统的子系统之间互为对等关系的研究基础上,根据更接近实际情况的串行系统两阶段结构图,建立了串行系统的DEA模型,考虑子系统之间的主从关系和共享资源配置,并提出一个基于公平设定中间产品目标值的非径向两阶段DEA模型。然后,以存款作为中间产品,将银行内部的经营过程划分为资金筹集和资金盈利两个过程,既解决了银行存款的关联性问题,同时也可以较真实地反映银行的运作过程,得出的结果更具参考价值。最后将我国10家上市银行企业作为决策单元,对各个银行在2012-2014年的筹资阶段和盈利阶段进行效率评价和共享资源的配置的算例分析,一方面综合考虑我国上市银行的整体效率和各阶段的个体效率以及共享资源的优化配置,另一方面提供银行应该如何进行公平设定存款目标值的思路。算例分析表明我国上市银行第一阶段的低效使得整体效率偏低,另外共享资源在不同阶段之间的分配比例显著影响各阶段的效率,进而影响系统整体效率;对基于公平设定中间产品目标的模型进行算例验证时,发现本文的方法需要的指标改进幅度不大,确定的生产计划更公平,也更容易被两阶段所接受。