HLA区间11个遗传标记多态性与鼻咽癌的相关性研究

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鼻咽癌(Nasopharyngeal Carcinoma,NPC)是一种起源于鼻咽上皮的恶性肿瘤,好发于中国南方诸省及香港、台湾、新加坡华人群体,流行病学调查显示男、女性发病率约为2-3:1。目前认为鼻咽癌系由遗传因素、EB病毒(Epstein-Barr Virus)持续感染及环境因素等共同作用所致,是一种多基因遗传性疾病,涉及多个遗传易感位点。编码人类白细胞抗原(Human Leucocyte Antigen,HLA)的基因复合体定位于6P21.3,既往研究发现HLA-B*35、B*38、B*46、B*58与不同地域华人鼻咽癌相关。MHC-Ⅰ类链相关基因A(MHC Class-ⅠChain Related Gene A,MICA)位于HLA-B基因近着丝粒端46kb,含6个外显子,所编码MICA分子为跨膜糖蛋白,其中,第5外显子编码跨膜区。MICA分子是重要的细胞应激(Cell Stress)分子,MICA分子结合NKG2D/DAP10受体,激活NK细胞、CD8+T细胞、γδT细胞以清除病毒感染细胞、突变细胞。我们的第一部分工作研究MICA基因第5外显子(GCT)n序列重复多态性(MICA-Short Tandem Repeat polymorphism,MICA-STR)与湖南地区汉族人群鼻咽癌的相关性。采用荧光聚合酶链式反应-基因扫描(Polymerase Chain Reaction/Size-Sequencing,PCR/Size-Sequencing)和聚合酶链式反应-序列特异性引物技术(PolymeraseChain Reaction/Sequence Specific Priming,PCR/SSP)分析湖南地区一组汉族NPC患者(218例)和该地区一组正常汉族对照人群(196例)的MICA-STR等位基因及MICA基因缺失(MICA*Del)频率。结果显示,MICA*A9频率在患者组显著高于对照组.(Pc=0.0001002,OR=2.528,95%CI=1.636-3.907),MICA*A5.1频率在患者组显著低于对照组(Pc=0.006,OR=0.594,95%CI=0.437-0.806)。按性别分层的比较显示,MICA*A9在男性患者组频率显著高于男性对照组(Pc=0.000072,OR=3.255,95%CI=1.855-5.709),MICA*A5.1在男性患者组的频率显著低于男性对照组(Pc=0.000737,OR=0.486,95%CI=0.337-0.702);各MICA-STR等位基因频率在女性患者组、女性对照组之间的差异无显著性(Pc>0.05)。进一步的分析显示,MICA*A9与NPC的关联同性别之间存在显著交互作用(Xw2=41.58,P=0.0001);在男性组,MICA*A5.1、MICA*A9与NPC的关联均存在基因拷贝数的剂量依赖关系:MICA*A5.1/MICA*A9杂合子的OR值明显高于其它MICA*A5.1携带者,但低于其它MICA*A9携带者。为建立湖南地区汉族人群MICA-STR,HLA-B单倍型数据库,并阐明该人群MICA*A5.1、MICA*A9与HLA-B基因之间的连锁关系,我们的第二部分工作采用荧光PCR/Size-Sequencing检测MICA-STR等位基因,采用PCR/SSP技术作HLA-B基因分型及检测MICA基因缺失,分析湖南地区58个随机选择的汉族正常核心家系共183个成员HLA-B、MICA-STR等位基因多态性,对85份无血缘关系的亲代样本数据作单倍型多样性、连锁不平衡(Linkage Disequilibrium,LD)分析。结果显示,170条HLA-B-MICA-STR亲代单倍型含30种HLA-B、MICA-STR组合方式,发现9种新的连锁类型;MICA*A9与HLA-B*35、B*38、B*51、B*58连锁,并与HLA-B*38、HLA-B*58呈显著连锁不平衡(△=0.0364,Pc=2.3558*10-4;△=0.0409,Pc=2.9830*10-4);MICA*5.1与HLA-B*07、B*08、B*13、B*27、B*37、B*39、B*48、B60连锁,并与HLA-B60呈显著连锁不平衡(△=0.1341,Pc=6866*10-11)。为阐明MICA-STR与HLA-B基因在NPC相关性的原发/继发关系,和鉴定性别特异的NPC遗传易感HLA单倍型,我们的第三部分工作对湖南地区127例连续的新发NPC患者、112例连续的正常对照人群(源自第一部分工作的研究对象)采用PCR/SSP技术作HLA-A、B、DRB1基因DNA分型。结果显示,HLA-B*35、B*38、B*58与MICA*A9均呈唯一性(Exclusive)连锁关系;男性NPC患者组HLA-B*58频率显著高于男性对照组(OR=9.975,95%CI=2.637-37.73,Pc=0.0034):男性NPC患者组HLA-DR17(DRB*03)频率显著高于男性对照组(OR=12.391,95%CI=2.05-75.01,Pc=0.0195);男性NPC患者组HLA-B60频率低于男性对照组,校正P值处于临界水平(OR=0.416,95%CI=0.22-0.787,Pc=0.055)。女性NPC患者组、女性对照组HLA-A、B、DRB1频率差异无显著性。在男性组,当HLA-B*58-MICA*A9单倍型携带DR17(DRB1*03)时,OR值增至12.391(95%CI=2.05-75.01,P=0.00154);当HLA-B*58-MICA*A9单倍型携带其它DRB1基因(Non-HLA-DR17)时,OR值明显下降(OR=5.734,95%CI=0.54-60.88,P=0.06)。此外,HLA-A*02、B*46在NPC患者组、对照组间(含按性别分层后的比较)的频率差异无显著性。我们第四部分工作分析位于HLA-Ⅰ类区远着丝粒端、HLA-A基因侧翼的7个多态性标记与湖南地区汉族人群NPC的相关性。采用荧光PCR/Size-Sequencing技术对D6S1624、D6S258、M6S211、D6S510等4个微卫星标记作分型,采用聚合酶链式反应-扩增片段长度多态性技术(Ampl ification Fragment Length Polymorphism,PCR/AFLP)检测AluyHF、AluyHG、AluyHJ的插入/缺失,分析该地区127例连续的新发NPC患者、112例连续的正常对照人群(同第三部分工作的研究对象)上述标记的频率差异。结果显示,该4个微卫星、3个AluyH家族成员的频率差异在NPC患者组、对照组间(含按性别分层后的比较)均无统计学上的意义。我们的研究结果首次表明:(1)MICA*A5.1、MICA*A9与湖南地区鼻咽癌关联,且呈现性别差异和基因拷贝数依赖关系;(2)初步构建该人群MICA-STR,HLA-B单倍型数据库,并发现9种新的MICA-STR,HLA-B连锁类型;(3)正常参照家系分析和病例一对照研究均显示,多个鼻咽癌相关HLA-B基因(含B*35、B*38、B*58)与MICA*A9连锁;(4)HLA-B*58-MICA*A9-DR17(DRB1*03)是该人群男性个体的一条鼻咽癌遗传易感HLA单倍型:(5)未发现HLA-Ⅰ类区远着丝粒端的7个多态性标记与湖南地区汉族人群NPC存在关联,我们提出该区域DNA遗传多态性与NPC关系的4种可能性。通过上述4部分DNA分型研究,我们首次报道,HLA-B至DRB1基因区间与湖南地区汉族人群NPC高度关联,且存在性别差异;我们的数据提示MICA*A9为湖南地区汉族人群鼻咽癌的一个原发(Primary)相关基因,基于MICA*A9与鼻咽癌相关HLA-B基因的连锁格局,提示MICA*A9可能为华人人群的一个共同的NPC易感标记;HLA-B*58-MICA*A9-DR17(DRB1*03)单倍型在HLA-B/DRB1区间存在未被认知的遗传缺陷,能调制(Modulate)NF-kappaB通路活性,进而与MICA*A9产生协同作用(Synergy),是进一步研究NPC高发于中国南方人群和揭示NPC发病存在男性优势的免疫遗传机制的一个良好模型。
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