近年来国际突发公共卫生事件屡次爆发,特别是2019年以来的新冠肺炎疫情,其传播速度、感染范围和社会危害前所未有,公共卫生重大风险防控成为我国现阶段国家治理的首要目标。国家审计是国家治理体系中一项基础性的制度安排,防范化解公共卫生领域的重大风险是国家审计发挥其预防、揭露和抵御功能的重要任务之一。海关检验检疫专项审计是海关审计的重要组成部分,也是公共卫生事件审计延伸的典型领域,是公共卫生风险防范的前置性关口。相对于重大公共卫生事件的审计迅速发展,对海关检验检疫专项审计领域关注较少,本文基于风险导向视角下研究海关检验检疫专项审计的重点和难点,化被动的应急审计为主动的健全海关检验检疫风险防控机制,对公共卫生风险防控机制的完善具有一定意义。本文首先介绍研究背景,基于风险导向视角开展海关检验检疫专项审计的必要性和可行性阐述研究意义。其次从风险管理、海关审计、公共卫生事件审计三个角度对相关的文献进行了综述,接着明晰本文风险管理理论、国家治理理论和公共受托责任理论的相关理论基础,层层介绍了海关检验检疫风险、海关检验检疫风险管理、基于风险导向视角下的海关检验检疫专项审计的内涵,并提出风险导向视角下海关检验检疫专项审计的实施框架。再次,本文以A市海关审计项目为例,从审计背景、审前准备、审计实施、审计发现等真实再现了海关审计中海关检验检疫专项审计的全过程,基于风险导向视角分析发现现阶段海关检验检疫专项审计存在审计力度不够、一线审计力量不足、组织形式不灵活、信息技术利用水平不高、审计后续程序不到位等问题。最后,基于上述发现的问题,提出进一步提升海关检验检疫专项审计的建议。目前对海关检验检疫专项审计专门的研究较少。本文基于风险导向视角研究海关检验检疫专项审计,具体分析了A市海关审计案例,基于风险导向视角详细分析和总结了现阶段海关检验检疫专项审计中存在的问题,为进一步提升海关检验检疫专项审计提出针对性的对策,以期为海关检验检疫专项审计的理论发展贡献一份力量。