microRNA是一类约为21-26个碱基长度的非编码单链RNA。microRNA在细胞生长和发育的过程中起着多种调节作用,参与生命过程中一系列的重要进程,包括发育、造血、器官形成、凋亡、细胞增殖、甚至肿瘤发生。microRNA对癌症、心脏病、艾滋病等各种疾病都有一定的影响。根据最近研究显示,RNA最初转录物(pri-RNA)分子经过RNaseⅢDrosha剪切,成为70-90个碱基大小、具有发夹结构的microRNA的前体(pre-microRNA),再由Exportin-5将pre-microRNA从细胞核运输到细胞质中,经Dicer酶加工生成microRNA o pre-microRNA最显著的特点就是具有发夹结构。pre-microRNA特殊的发夹结构不仅能够使pre-microRNA与Exportin-5结合从而输出到细胞质,而且还是其与Dicer酶作用的必要结构。这两点就使得发夹结构对于microRNA和pre-microRNA都非常重要。根据microRNAs前体序列的碱基保守特征和二级结构特征,应用多样性增量方法(ID方法)和支持向量机(SVM)分析,以内含子区(intron)、外显子区(exon)、基因间区(intergenic)三类序列分别作为负集,对人类的pre-miRNAs进行分析和预测。当以intergenic区和intron区序列为训练负集时,其以二级结构三联体、四联体和五联体(3-mer、4-mer、5-mer)为特征参量的敏感性、特异性、整体精度都在89%以上,相关系数在0.7以上。