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[目的]用蛋白组学方法,通过对膝关节骨关节炎不同中医分型患者与膝关节创伤性滑膜炎关节滑液中蛋白组的比较,寻找各自差异表达蛋白并探讨三种不同中医分型的物质基础。[方法]筛选2011年1月1日到2013年1月31日15例在贵阳中医学院附属第一医院骨科治疗的三种不同分型的膝关节骨关节炎患者按照中医辩证分型进行分组：肾虚髓亏型(5例)阳虚寒凝型(5例)、瘀血阻滞型(5例),创伤性滑膜炎患者为对照组(5例),分别抽取关节液,对其进行蛋白定量分析,找出差异蛋白,对其治疗组根据辩证分型采用对证方剂进行治疗。[结果]实验共鉴定到差异蛋白质组为251个,七个通道皆有定量信息246个。对7组样品分别进行Aa与D、Ba与D、Ca与D、Aa与Ab、Ba与Bb、Ca与Cb之间的显著性分析并计算其显著性指数,三组治疗组与对照组共计检测出32个差异蛋白(p<0.01),其中,可能为骨关节炎与创伤性滑膜炎差异蛋白9个：组蛋白H4、组蛋白H2A、S100钙结合蛋白A8、纤维蛋白原γ、纤维蛋白原α、cDNA(FLJ92148)、C4b结合蛋白、部分转酮醇酶变异体、基膜聚糖基因,前8个为低表达,基膜聚糖基因为高表达。HIST1H2BC、髓过氧化物酶在Aa组含量少于D组与Ab组,血清淀粉样P蛋白、载脂蛋白C-I变异体在Ba组含量少于D组与Bb组,组蛋白H2A、C反应蛋白、纤维蛋白原a在Ca组含量少于D组与Cb组。[结论]组蛋白H4、组蛋白H2A、S100钙结合蛋白A8、纤维蛋白原Y、纤维蛋白原α、cDNA(FLJ92148)、C4b结合蛋白、部分转酮醇酶变异体、基膜聚糖基因9个蛋白可能为骨关节炎与创伤性滑膜炎的差异蛋白,其差异蛋白可作为标记物对疾病进一步研究,HIST1H2BC、髓过氧化物酶可能为肾虚髓亏型骨关节炎与其他两型区分的差异蛋白,血清淀粉样P蛋白、载脂蛋白C-I变异体可能为阳虚寒凝型差异蛋白,组蛋白H2A、C反应蛋白、纤维蛋白原a可能为瘀血阻滞型差异蛋白,三种不同分型的骨关节炎证型的蛋白差异,为中医临床分型及治疗提供物质基础。肾虚髓亏型、阳虚寒凝型0A中滑液具有较好的蛋白相关性。