猫STR基因座复合扩增体系的构建及法医学应用研究

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目的构建一个猫STR基因座荧光复合扩增检测体系,并对其技术性能进行测试,评估其法医学应用价值。方法1.基于对文献中已发表的猫STR基因座数据资料的整理和分析,筛选可用于猫个体识别和亲缘关系鉴定的STR基因座。使用Primer Premier 5.0(Premier Biosoft,Indore)软件和引物比对搜索工具(Primer-BLAST)设计所选基因座引物,对上述所选基因座单点扩增后进行琼脂糖电泳,确认引物可扩增出特异性条带。2.将筛选的16个常染色体STR基因座和1个性别鉴定基因座分为四组,每组各基因座的正向引物5’端分别标记上荧光染料(6’FAM、HEX、TAMRA和ROX)。对复合扩增体系的PCR反应条件进行摸索和优化,使各基因座扩增产物达到基本平衡、特异的要求。3.根据DNA分析方法科学工作组(Scientific Working Group on DNA Analysis Methods,SWGDAM)和国际法医遗传学会(International Society for Forensic Genetics,ISFG)的要求,对构建的猫荧光复合扩增检测体系进行灵敏度、种属特异性、精确性、均衡性等法医学验证研究,并对145份猫无关个体进行群体遗传学调查。结果1.本研究筛选出猫的16个常染色体STR基因座(FCA733、FCA391、FCA740、F27、FCA453、FCA734、F85、F124、FCA742、FCA736、FCA730、FCA749、FCA559、FCA723、FCA441、FCA732)和1个性别鉴定位点SRY,成功构建了包含上述17个基因座的荧光复合扩增检测体系。2.本研究对构建的复合扩增体系进行法医学验证的结果显示,当DNA模板量低至0.25ng时仍可得到17个基因座的完整分型,检测同一个体的不同组织、重复检测同一样本均得到一致的分型结果,检测其他常见动物样本时未见特异性扩增峰。3.本研究对构建的复合扩增荧光检测体系进行群体遗传学调查。16个常染色体STR基因座在145例样本中共观察到259个等位基因,16个常染色体在145例样本中等位基因杂合度分布在0.531(FCA391、FCA732)-0.876(F85)之间,平均杂合度为0.687;多态信息含量分布在0.664(FCA441)-0.952(F85)之间,平均为0.790;随机匹配概率分布在0.012(F85)-0.133(FCA732),平均为0.034。16个基因座的个体识别率≥0.867(FCA732),非父排除概率≥0.216(FCA391、FCA732)。累计个体识别概率为1-3.59×10-20,累计非父排除概率为1-6.35×10-5,累计随机匹配概率为3.61×10-20。结论本研究构建了包含16个猫常染色体STR基因座和1个性别鉴定位点的荧光复合扩增体系,该体系灵敏度高、种属特异性好、分型结果准确,能够为司法鉴定领域中涉及猫的种属鉴定、个体识别及亲缘关系鉴定提供有效的检测手段。
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