HPA1-28w基因分型方法的研究和血小板供者基因库的建立及应用

来源 :温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:peking521
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目的:  建立血小板同种抗原(HPA1-28w)系统测序分型技术(PCR-SBT)基因诊断方法,并建立无偿献血者血小板HPA、HLA-A、B基因数据库,评估HPA1-28w系统错配的概率。利用建立的血小板基因型数据库,为血小板输注无效患者选择基因“数字化”配合的供者,为有效解决血小板输注无效提供一种可行的方法,进一步提高临床输血安全。  方法:  1.采用商用基因组DNA抽提试剂盒,利用自动抽提设备对样本基因组DNA进行抽提。样本来自随机的1060例单采血小板献血者,征其知情同意后采集全血标本。  2.从欧洲免疫多态性数据库(the Immuno Polymorphism Database,IPD:www.ebi.ac.uk/ipd/hpa)中下载HPA1-28w所在基因的核酸序列信息及各HPA相关的核苷酸多态性位点,利用Primer3.0(v.0.4.0)软件设计引物,优化PCR参数,实现同一扩增条件下扩增HPA1-28w系统。然后采用商用试剂(ABI Bigdye3.1)参照试剂说明进行测序反应,利用ABI SeqScape V2.5软件进行HPA序列比对分析。  3.采用商用试剂进行HLA-A,B位点基因分型,参照试剂说明进行操作。采用Assign3.5 SBT分析软件确定标本HLA等位基因,HLA-A,B位点等位基因频率采用直接计数法计算,单体型频率及 Hardy–Weinberg遗传平衡检验均采用Arlequin软件分析。P<0.05表示差异具有统计学意义。  4.采用单克隆抗体特异的血小板抗原固定试验(MAIPA)方法检测PTR患者HPA抗体和HLA抗体。按照交叉反应组(CREGs)配合技术在血小板供者数据库选择供者,配型分级按照美国AABB血小板HLA配型分级标准。  5.HPA等位基因频率采用直接计数法计算,Hardy–Weinberg遗传平衡检验采用SPSS13.0软件,P<0.05表示差异具有统计学意义。HPA抗原不配合概率的计算公式为a抗原不配合概率=b2(1-b2),b抗原不配合概率=a2(1-a2);HPA抗原随机输注不配合概率=a2(1-a2)+b2(1-b2)。  结果:  1.建立了HPA1-28w系统的PCR-SBT基因分型方法,所有HPA系统在同一条件下实现多重PCR扩增。多重PCR扩增后每组均能得到明显的三个条带,且三个条带均呈现一定的强度,扩增产物片段长度在272bp到695bp之间,与预期大小一致。除HPA-5系统反向引物测序时会出现多态性位点后续碱基峰杂乱外,其他HPA抗原系统正反两向引物测序均得到明显清楚的结果。检测国际输血协会血小板免疫学Workshop的10份考核样本,分型结果与提供的参考结果完全一致。  2.在检测的1060例样本中,HPA-1、2、3、4、5、6w、15、21w系统存在多态性,其他HPA系统只检测出HPA-aa基因型。其中HPA-1系统a频率为0.9948,b频率为0.0052;HPA-2系统a频率为0.9410,b频率为0.0590;HPA-3系统a频率为0.5316,b频率为0.4684;HPA-4系统a频率为0.9981,b频率为0.0019;HPA-5系统a频率为0.9882,b频率为0.0118;HPA-6w系统a频率为0.9835,b频率为0.0165;HPA-15系统a频率为0.5330,b频率为0.4670;HPA-21w系统a频率为0.9915,b频率为0.0085。  3.HPA-1、2、3、4、5、6w、15、21w系统错配的概率分别为0.01027,0.10481,0.37400,0.00376,0.02304,0.03195,0.37391,0.01670。在不考虑ABO血型的情况,理论上出现一个HPA-1系统bb纯合子,需要37144例供者。出现一个HPA-4系统bb纯合子,需要280900例供者。出现一个HPA-5系统bb纯合子,需要7191例供者。出现一个HPA-6w系统bb纯合子,需要3669例供者。出现一个HPA-21w系统bb纯合子,需要13872例供者。  4.分析显示1060例样本中HLA-A,B位点分布符合Hardy-Weinberg平衡分析。HLA-A观察杂合度为0.87736,预期杂合度为0.88486,P值为0.14095;HLA-B观察杂合度为0.93774,预期杂合度为0.94668,P值为0.22917。HLA-A等位基因频率最高为A*11:01,大于1%的等位基因有A*24:02、A*02:01、A*02:07、A*33:03、A*26:01、A*02:03、A*02:06、A*03:01、A*11:02、A*31:01、A*30:01、A*01:01,累计频率达到95.85%。HLA-B等位基因频率最高为B*46:01,大于1%的等位基因有B*40:01、B*58:01、B*07:02、B*13:01、B*13:02、B*15:01、B*15:02、B*15:11、B*39:01、B*40:02、B*40:06、B*15:18、B*48:01、B*44:03、B*51:01、B*27:04、B*35:01、B*37:01、B*38:02、B*55:02、B*54:01、B*52:01、B*15:27,累计频率达到89.48%。  5.按照HLA抗原交叉反应组进行分类:1C组为38.0660%;2C组为57.1699%;4C组为53.2075%;5C组为40.4719%;6C为49.9527%;7C为41.5565%;8C组为7.4527%;10C组为13.5378%;12C组为30.1414%。按照B1X配合度,估算患者(8C组患者)至少搜寻到1个B1X配合级供者时,理论上需要32414个供者。  6.用MAIPA方法分析32例血小板输注无效标本,其中26例检测出HLA抗体,1例同时检出HLA抗体和抗HPA-15抗体。对9例申请数据库搜寻血小板供者的PTR患者利用基因“数字化”数据配合技术进行血小板供者筛选,其中4例筛选到A级匹配供者、2例筛选到B1U级供者、2例筛选到B1X级供者,筛选的血小板输注后临床症状改善明显,止血效果良好。  结论:  1.建立了同一扩增体系条件下血小板同种抗原系统HPA1-28w基因测序诊断技术,方法准确有效。  2.建立了1060例浙江汉族已知基因型的血小板供者数据库。  3.发现人群中HPA-1、2、3、4、5、6w、15、21w系统存在多态性,其他系统呈现单一型,首次获取了人群HPA22w-28w等位基因频率,评估了HPA1-28w系统随机输注时抗原错配的概率。  4.获取了浙江汉族人群HLA-A、HLA-B等位基因频率及单体型分布情况。  5.进行了血小板基因“数字化”数据配合,交叉反应组配合程度在A级和B级的患者在输注后效果良好,为解决免疫性血小板输注无效提供了一种可行的方法。
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