生物遗传多样性是指生命有机体与其借以存在的生态复合体相互作用产生的多样性和变异性，是生物界进化产生的宝贵资源，对它的研究具有十分重要的实践意义。中国现有黄52种，是世界上牛种最丰富的国家。近几十年来，为满足人民对肉、奶等畜产品的需求，我国相继引进了大量的外来高产品种，对低产地方品种进行改良，使畜牧生产水平大幅度提高，但改良的消极后果就是导致具有丰富多样性的地方品种群体数量下降或消失。　　 DNA分子标记是近几十年来发展起来的一套分析生物遗传多样性的有效方法，其中包括限制片段长度多态性，随机扩增多态性DNA，单核苷酸多态性，简单重复序列长度多态性等等。简单重复序列，又称微卫星DNA，相比较于其他分子标记，具有以下特点：共显性；所需DNA量少；均匀分布于基因组中；重复性好；多态性丰富。　　 本研究就是借助于简单重复序列，对四个中国地方良种(秦川牛，鲁西牛，南阳黄牛，郏县红牛)和六个引进牛种(荷斯坦奶牛，西门塔尔牛，夏洛莱牛，利木赞牛，安格斯牛，短角牛)进行遗传多态性分析。本研究收集和选择了7个微卫星多态性位点，通过PCR和聚丙烯酰胺凝胶变性电泳分析，发现7个位点都具有丰富的等位基因。其中郏县红牛具有最多的特有等位基因，说明其受到外来物种的影响比较小。本研究中的基因流指数Nem均小于1，说明遗传分化的趋势明显。利用popgene软件计算Nei氏标准遗传距离和遗传一致度发现国内品种之间的遗传距离较小，遗传一致度较大。使用NTSYS软件对这7个位点的遗传多态性分析，发现中国黄牛都在一定程度上和引进物种混在一起，并没有按照各自的品种聚成几类，说明中国黄牛都不同程度的接受了进口品种的改良或影响。