长链非编码RNA CUDR在胰腺癌中功能及机制的初步探讨

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[研究目的]1、筛选与分析在胰腺癌中具有差异性表达的信使RNA (messenger RNA, mRNA)与长链非编码RNA (long noncoding RNA,lncRNA),从中得到胰腺癌发生发展的潜在关键性lncRNAs;2、初步探讨潜在关键性lncRNA对胰腺癌细胞生物学行为的影响及其机制。[研究方法]1、将5对胰腺导管腺癌及癌旁组织的高通量基因芯片进行扫描,筛选分析在胰腺癌组织中具有差异性表达的信使RNA与长链非编码RNA,并利用分层聚类分析探讨所得差异性表达谱的可靠性;2、利用GO分析、Pathway分析、构建mRNA-lncRNA共表达网络,结合目前国内外已有的文献报道,以及多个在线数据库,对差异性表达的mRNA与lncRNA进行分析,筛选在胰腺导管腺癌发生发展中的潜在关键性lncRNAs,并预测其可能参与的作用及通路机制;3、选取预测的潜在关键性lncRNA作为研究对象,利用qRT-PCR技术,在20例临床手术标本上验证其表达水平,并结合临床数据进行统计学分析,探讨潜在关键性lncRNA的表达水平是否与胰腺癌肿瘤临床恶性程度、侵犯转移等生物学行为相关;4、构建过表达选取的潜在关键性lncRNA的稳转胰腺癌细胞系模型,通过MTT、细胞划痕实验、Transwell侵袭实验,在细胞水平上探讨过表达该lncRNA对胰腺癌细胞生物学行为的影响,并利用Western Blot技术对其机制进行初步探讨。[结果]1、按照按上调或下调5倍,p值小于0.01的标准,筛选得到在胰腺导管腺癌及癌旁组织中表达具有差异的mRNAs713个,lncRNAs414个,分层聚类分析提示所得差异性表达谱结果可靠;2、对差异性表达谱进行生物学分析,得到具有显著性意义的上调通路77条,下调通路33条。进一步分析与胰腺癌发生发展相关的10余条具有统计学意义的信号通路,归类于这些通路的差异性基因中,YWHAZ、CDH3、NTRK1、BIRC3、LAMC2、 KRAS、ITGA2等7个基因在共表达网络中处于中心位置。与之相关的并同时处于共表达网络中心环节的lncRNAs有AC112229.1、CUDR,RPL35AP、AC090377.1、 RP11-534L6.2、SAT1、AC027119.1、BC042017、RP11-738E22.1、AC015818.5等11个。3、对比11个IncRNAs的原始数据,选取相对优势数据CUDR作为进一步研究对象;20对临床手术胰腺癌/癌旁组织标本的qRT-PCR结果提示CUDR在胰腺导管腺癌组织中高表达,统计学分析提示CUDR表达水平与临床患者肿瘤分化、侵犯程度及淋巴结转移情况显著相关;4、利用全基因组合成及逆转录病毒转染技术,在胰腺癌细胞Panc-1上成功构建CUDR过表达稳转细胞系Panc-1-CUDR及其阴性对照Panc-1-MOCK;并通过体外细胞实验,证实CUDR表达上调可促进胰腺癌细胞Panc-1的增殖、迁移、侵袭能力。其机制与激活AKT通路,调控胰腺癌细胞上皮细胞间质化(EMT)相关。[结论]1、lncRNAs与胰腺导管腺癌的发生发展密切相关,对其进一步的研究在胰腺导管腺癌的诊断、治疗、预后等方面具有重要意义;2、CUDR可调控胰腺癌的生长、侵袭、转移的恶性生物学行为,在胰腺导管腺癌发生发展中发挥重要作用,其机制与调控FAK/PI3K/AKT通路,刺激胰腺癌细胞(EMT)相关。
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