三株海洋细菌的多相分类鉴定

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本文对分离自西太平洋深海沉积物的三个潜在新分类单元,运用现代多相分类鉴定技术,对其进行形态学、生理生化特征、化学分类特征及分子分类的鉴定,确定了这三株菌的最终分类地位,主要结果如下:  (1)菌株GY0574T是革兰氏阳性菌,不运动,无鞭毛。改良2216E培养基28℃培养4天,透射电镜下观察,细胞呈杆状,大小约0.4-0.6μm×0.7-1.2μm,成对或短链生长。在改良2216E培养基上28℃培养7天的克隆为淡黄色,圆形,直径0.5 mm左右,形态规则,不透明,微凸起,菌落表面光滑。该菌的温度生长范围是15-40℃(最适为35-37℃),pH范围是5-9.5(最适pH为7-8),盐度范围是0-13%(最适盐度为3.5-7%)。通过16S rRNA基因序列比对,菌株GY0574T与已知典型种 Lentibacillus juripiscarius IS40-3T(95.81%)和Virgibacillus soli CC-YMP-6T(95.36%)具有最高16S rRNA基因序列相似性。主要的极性脂为双磷脂酰甘油、磷脂酰甘油、磷脂酰胆碱、未知的糖脂和未知的磷脂;主要的醌为MK-7;主要的脂肪酸包括iso-C16:0(34.97%)和anteiso-C15:0(32.56%);G+C mol%含量为42.6%。菌株GY0574T为新属,命名为Brevilentibacillus brevis。典型菌株为GY0574T=MCCC1A10572T。  (2)菌株GY0565T是革兰氏阴性菌。在改良2216E培养基上28℃培养4天,透射电镜下观察,细胞呈棒状,大小约0.4-0.6μm×0.7-1.5μm,成对或短链生长。在改良2216E培养基上28度培养7天的克隆为橘红色,圆形,直径1 mm左右,形态规则,不透明,微凸起,菌落表面光滑。该菌的温度生长范围为4-40℃(最适为30-35℃),pH范围为3-10(最适pH为7-9),盐度范围为0-14%(最适盐度为3.5%)。通过16S rRNA基因序列比对,菌株GY0565T与已知典型种:Hephaestia caeni ERB1-3T(95.82%)和Sphingomonas indicaDd16T(95.08%)具有最高16S rRNA基因序列相似性。主要的极性脂为双磷脂酰甘油、磷脂酰胆碱、磷脂酰乙醇胺、未知的糖脂、磷脂酰甘油;主要的醌为Q-10;主要的脂肪酸包括Summed Feature8(C18:1w7c and/or C18:1w6c,35.34%)和C17:1w6c(35.09%);G+Cmol%含量68.2%。菌株GY0565T为新属,命名为Sphingobacter tangerine,典型菌株为GY0565T=MCCC1A10569T。  (3)菌株GY0581T是革兰氏阴性菌,不运动,无鞭毛。在改良2216E培养基28℃培养4天,在透射电镜下观察,细胞呈球状,大小约0.4-0.5μm×0.4-0.5μm。在改良2216E培养基上37℃培养7天的克隆为橘黄色,圆形,直径2 mm左右,形态规则,不透明,微凸起,表面光滑。该菌的温度生长范围为15-40℃(最适为35-37℃),pH范围为5-10.5(最适pH为7-8),盐度范围为0-6%(最适盐度为3.5%)。通过16S rRNA基因序列比对,菌株 GY0581T与已知典型种Paracoccus sediminis KMB17T(98.1%)具有最高16S rRNA基因序列相似性。主要的极性脂为甲基磷脂酰乙醇胺、磷脂酰甘油、磷脂酰胆碱、磷脂酰乙醇胺、未知的氨脂质、未知的磷脂和未知的糖脂;主要的醌为 Q-10;主要的脂肪酸包括Summed Feature8(79.46%)及C18:0(9.44%);G+C mol%含量为67.1%。GY0581T属于副球菌属(Paracoccus)的一个新种,命名为Paracoccus croci,典型菌株为GY0581T=MCCC1A10575T。
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