近年来,我国非营利组织飞速发展,从2006年开始,我国部分城市开始尝试以公益创投的形式,支持非营利组织成长,推动公益事业发展。在2012年党的十八大报告中,明确提出“通过社会体制改革、政府职能转变的方式促进社会组织发展”,这表明在未来一段时间,政府将更多的通过公益创投的形式推进社会管理创新。为了加强公益创投项目中政府创投资金使用的监管力度,提高投资决策的科学化水平和投资效益,本文在文献研究和实证研究的基础上,构建了非营利组织的公益创投项目评估体系。结合非营利组织公益创投项目的实际特点,本文在借鉴了平衡计分卡的基础上,构建了财务绩效、客户绩效、过程绩效、社会服务绩效和机构能力成长绩效5个维度的非营利组织公益创投评估指标体系,并结合利益相关者理论又进一步细分为21个三级指标。在评估指标体系的基础上,通过层次分析法确定了各层级指标权重,并运用模糊综合评价法对公益创投项目进行评估。该评估体系在南京市玄武区民政局2011-2012年公益创投项目评估中得到了应用,起到了较好的评估效果,得到了非营利组织、政府及服务对象的一致认可。但在实际公益创投项目评估过程中,也发现了一些存在问题。笔者分别从政府、非营利组织及第三方评估机构3个层面提出对非营利组织的公益创投项目改进建议。