我国水电资源蕴含量丰富，开发利用水电资源，对实现节能减排目标有重要的意义。我国农村水电以小水电为主，经过多年发展，小水电已逐渐成为我国农村地区经济社会发展的重要基础设施。随着近年水电农村电气化建设资金的投入，农村水电建设规模进一步扩大，水电装机容量在电网中所占比重也逐渐增大，小水电上网电能质量直接关系到了电网供电质量。建立一个相对优良的电能质量评估系统，科学、合理地对电能质量进行评估，对建立公平的电力市场，有效地指导电力企业的管理，提高供电质量，降低发供电成本和电价以及科学、经济地解决小水电电能质量的有关问题意义重大。围绕电能质量这一主题，首先，本文分析了国家电能质量标准规定的几个指标对电能质量的影响，分析了小水电易出现电压不稳定和欠发无功的特点，确定了适合小水电的电能质量评估指标体系；然后，本文分析了现有的几种主要的赋权方法的特点，并对层次分析法进行了改进，提出了一种基于改进层次分析法和熵值法的组合赋权方法；而后，本文分析了现有电能质量评估方法，提出了一种采用灰色关联分析法构造模糊评判关系矩阵的主客观组合赋权的电能质量灰色模糊综合评估模型。算例研究表明，本文提出的评估模型用于小水电电能质量的综合评估是有效可行的。这种方法既能够对数据样本的电能质量进行整体评估，又可以对同一等级的电能质量进行精细的评估，还能够反映电能质量各分项指标的优劣情况，能够为电力市场环境下电网按质定价以及小水电站的自我调整与改进提供参考。最后，本文采用Matlab软件实现了综合评估的主要算法部分程序，用VB编写了软件界面，并采用了能够脱离Matlab工作环境的COM组件技术实现了VB与Matlab混合编程，最终研制成了一个综合评估软件。通过多次的调试和实测数据验证，该软件能够给出合理的综合评价结果，运行稳定可靠。