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2003年至2005年，在烤烟苗期、大田期对毕节地区主要烟区主要病虫害发生情况进行调查，结果表明，烟草病毒病(TMV、CMV和PVY)、赤星病、青枯病、黑胫病、根结线虫病、烟青虫和烟蚜为轻度发生或偏轻度发生。烟草病毒病(主要由蚜虫传播)有逐年加重的趋势，其中2003、2004和2005年的病情指数分别为0.16、0.22和2.18。2005年烟草花叶病造成烟叶产值损失率和产量损失率分别为3.437％和2.635％。2003年烟青虫虫量为23头／百株，发生面积为1.4万hm~2，产值损失率和产量损失率分别为1.591％和1.2％，是2003年为害最严重的病虫害之一。赤星病空中孢子量与田间发病程度呈正相关，但田间实际发病情况受气候等因素的影响。赤星病田间始发期为7月上旬，随后发病程度和病指有所增加。2003、2004、2005年最高病情指数为21.14、1515、3.14，年度间发病程度呈下降趋势。烟青虫发生高峰期为6月中下旬，高峰期百株虫量分别为：大方县15.0头、金沙县8.0头。三年综合防治区各病虫的平均防效依次为：黑胫病58.1％、烟蚜55.54％、赤星病49.9％、烟青虫45.76％、病毒病35.99％、地老虎35.49％、青枯病18.75％。三年来对病毒病的防效是逐年提高的，2005年防效为57.33％，与2003年防效23.97％和2004年防效26.67％差异显著(P＜0.05)。对根茎性病害的综合防治在进行农业措施防治的同时，关键时期用58％的甲霜灵猛锌可湿性粉剂防治效果好。利用集成技术建立综合防治示范区，防治效益明显。三年病虫害综合防治示范面积为772hm~2，累计挽回经济损失估计为113万元，累计增加净收入估计为108万元。