慢性胃炎患者胃微生态特征分析

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目的幽门螺杆菌感染是慢性胃炎的主要原因,但非幽门螺杆菌胃微生物群在慢性胃炎发生中的作用仍不清楚。本研究旨在分析不同内镜表现、不同病理诊断以及不同幽门螺杆菌感染状态慢性胃炎患者的胃微生态特征和功能。方法本研究共纳入在2020年10月-2021年4月于我院行胃镜检查诊断慢性胃炎患者75例。根据疾病内镜下诊断(萎缩性胃炎、糜烂性胃炎、斑片状糜烂胃炎、片状糜烂胃炎、条状糜烂胃炎、隆起性糜烂胃炎、凹陷性糜烂胃炎、散在性糜烂扁平隆起性胃炎、增生性胃炎)和病理诊断(浅表性胃炎、糜烂性胃炎、萎缩性胃炎、肠化生、上皮内瘤变、增生性息肉)分组。本研究采用16SrRNA高通量基因测序分析胃黏膜组织中的胃微生物种类。在门、纲、目、科、属、种等不同水平对α多样性进行分析,Observed-species Index和Chao1 Index反映胃黏膜组织菌群丰度,Shannon Index和Simpson Index反映胃黏膜组织菌群多样性。采用线性判别分析效应量法评估各组慢性胃炎患者的微生物组成差异,利用PICRUSt获得了胃微生物群落的预测功能图谱。采用卡方检验和t检验进行统计学分析。结果研究发现,75名慢性胃炎患者所有胃活检组织样本中共鉴定出87个细菌门。对于不同内镜表现慢性胃炎的α多样性分析,Observed-species Index在萎缩与条状糜烂、条状糜烂与增生、片状糜烂与条状糜烂等两组间显著性p值为0.0131、0.0156、0.0175 等,差异有统计学意义(p<0.05);Shannon Index 在萎缩与条状糜烂、条状糜烂与隆起糜烂、片状糜烂与条状糜烂等两组之间的差异具有统计学意义(p<0.05),显著性p值为0.0134、0.0171、0.0317;β多样性分析显示萎缩与片状糜烂慢性胃炎患者的菌群组成差异有统计学意义(ADONIS R=0.084,P=0.034),NMDS应力值小于0.2(stress=0.116)。不同病理诊断慢性胃炎稀疏曲线和Rank Abundance曲线均显示增生性息肉病理组织类型丰度及均匀度最高且具有较高的细菌多样性;物种丰度和均匀度从萎缩、肠化生到上皮内瘤变逐渐降低;浅表性胃炎组物种丰度和均匀度最低。基于OTU水平分析的Venn图显示,病例数较少的Hp阴性组物种丰度高于Hp阳性组。在门水平上,Hp阴性组中以厚壁菌门丰度最高,拟杆菌门次之,而Hp阳性组以弯曲菌门丰度最高,其次为厚壁菌门;在种水平上,Hp阴性组中柔嫩梭菌为优势菌,Hp阳性组中幽门螺杆菌为优势菌。基于种水平的随机森林分析,不同内镜表现慢性胃炎的萎缩与斑片状糜烂中,比较ROC曲线得到的AUC值为0.8688;而在不同病理组织慢性胃炎的肠化生与浅表性胃炎、糜烂性胃炎与肠化生、糜烂性胃炎与浅表性胃炎中,本研究通过ROC曲线分析得到的AUC值为分别为:0.9318、0.9300、0.9500。结论通过对慢性胃炎患者胃黏膜微生物菌群的详细分析,发现不同内镜表现、不同病理诊断以及不同幽门螺杆菌感染状态胃黏膜微生物菌群丰度和构成存在差异,胃微生物组成和功能的变化模式是慢性胃炎发生发展的高度指示。
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