业主委托多个具有不同知识、技术等的企业承担各项工程作业已成为大型复杂项目实施的主旋律。项目的效益,甚至是项目的成败与各企业的行为,尤其是创新行为息息相关。不确定的项目产出、可能的技术溢出,以及过渡时期,我国大型复杂项目组织结构具有准市场特征等,这些都将在很大程度上对工程承包商的行为选择造成影响。本文正是基于对合作内容和合作环境对项目参与主体合作行为选择的影响的考虑,对不同纽带联结的准市场组织进行分析,对准市场组织下工程承包商的合作创新行为进行研究。首先,分析我国大型复杂项目组织具有准市场特征的现实性,以及可能面临的管理问题,进而提出本文研究的必要性、理论价值和现实意义,确定本文研究的目标、内容、方法和技术路线,并介绍相关理论。其次,分析经济转型期我国大型复杂项目的准市场组织结构,探讨不同纽带联结的准市场组织下工程承包商合作创新行为产生的条件,以及业主相应的激励要点,据此提出相关理论命题,构建起后续研究的理论分析框架。再次,应用演化博弈理论和方法,研究具有亲缘关系的项目业主和工程承包商之间的合作创新机制。基于对亲缘关系、信任关系,创新风险、技术溢出的考虑,构建工程承包商合作创新的复制动态模型进行分析,并通过数值模拟对理论分析结果进行检验。研究结果显示,较强的亲缘利他偏好和良好的信任关系,对工程承包商的合作创新行为、对超额收益分配的激励效果具有促进作用;较高的溢出损失和创新风险,对工程承包商的合作创新行为、对超额收益分配的激励效果具有阻碍作用。进一步运用netlogo软件进行多代理仿真,对不同超额收益分配系数和不同补贴系数下亲缘工程承包商的行为演化及业主的收益演化进行探讨。研究结果表明,超额收益分配是促进工程承包商合作创新,提高业主收益的有效措施;在考虑亲缘关系的情况下,业主补贴能够在一定程度上提高超额收益分配机制的激励效果,但在不合理的分配系数下,业主补贴的激励作用可能失效;溢出效应较大时,业主补贴对工程承包商创新投入的促进作用更大,合理的补贴系数可随着溢出效应系数的增大而相对减小。而后,针对经济转型期,业主同时从内、外部市场选择工程承包商参与项目建设这种情况下所构成的项目准市场组织结构,运用演化博弈理论和方法,系统地研究项目参与主体间的合作创新机制。分析各类工程承包商合作策略选择的动态演化过程,以及创新风险、技术溢出等因素,尤其是亲缘利他偏好和非制度惩罚对各类工程承包商行为选择的影响。研究结果表明,对经原有企业改制而形成的工程承包商,基于亲缘联结,增强其亲缘利他效用和信任程度;对于新进入者,适度加大开放和完善工程承包市场,增强非制度集体惩罚,可分别起到降低各类工程承包商对超额收益分配的依赖程度,加强各类工程承包商与业主合作创新的作用。进一步考虑工程承包商之间的横向竞争关系,建立委托代理模型,探讨业主设置锦标赛和信用评价竞赛机制来激励工程承包商合作创新行为的问题,分析内、外部工程承包商能力相同和不相同时,两种竞赛机制对工程承包商行为决策和业主收益的影响。研究表明,能力不相同时,亲缘利他偏好、信用评价奖惩程度越大,工程承包商的创新努力投入越大,在其他参数一定时,仅当信用评价奖惩系数满足一定条件,锦标赛机制才对工程承包商的合作创新行为具有激励作用。能力相同时,随机干扰、技术溢出水平越小,信用评价奖惩程度、锦标激励约束奖金越大,工程承包商的创新努力投入越大,相较外部工程承包商,亲缘内部工程承包商的创新努力投入更高。此外,还通过案例研究来对理论分析结果进行验证,以体现论文研究对项目管理实践的现实指导意义。最后总结研究结论,指出研究不足和未来研究方向。