努日铜钨钼矿床构造上位于冈底斯燕山—喜马拉雅期陆缘岩浆弧的东段、雅鲁藏布江板块缝合带北缘,是冈底斯成矿带中一个典型的矽卡岩型矿床。矿床产于晚白垩世闪长岩和始新世花岗闪长岩与比马组四段（K₁b⁴）地层的接触带及其附近,经历了至少两期矽卡岩活动,受地层、岩浆岩和构造的共同控制。节理裂隙与褶皱隆起形成了节理裂隙以及层间破碎带,为矿床的形成提供了良好的储矿空间。选取各次热液活动形成的石榴子石、石英及方解石进行流体包裹体研究表明,包裹体类型主要有气液两相包裹体和含子矿物多相包裹体。努日铜钨钼矿床均一温度为163.0℃⁵64℃,盐度范围3.1⁵2.8 wt%Nacleqv。其中第一、二次形成石榴子石的热液温度560℃⁵64℃,盐度可到达49.7⁵5.8wt%Nacleqv;第三次形成磁铁矿和石英的热液温度340.1℃³45.7℃,盐度7.1⁷.5wt%Nacleqv;第四次形成无矿石英脉的热液温度272.9℃³10.6℃,盐度3.1⁷.4wt%Nacleqv;第五次形成黄铜矿与辉钼矿的热液温度为286.7℃,盐度6.3 wt%Nacleqv;第六次形成石英—硫化物脉的热液温度264.9℃²65.6℃,盐度为8.0 wt%Nacleqv;第七次形成无矿石英脉的热液温度217.7℃²54.8℃,盐度7.3⁷.9wt%Nacleqv;第八次形成方解石脉的热液温度166.9℃¹76.4℃,盐度6.9wt%Nacleqv。可见,与金属氧化物形成有关的高温热液,温度为340.1℃³45.7℃。与金属硫化物形成有关的中温热液,温度为264.9℃²86.7℃。热液从高温度、高盐度演化为低温度、低盐度,经历了复杂的过程,且各次热液形成的矿物中流体包裹体温度及盐度有叠加部分,推测为不同物理化学性质的多次热液叠加改造的结果。由经验公式估算,努日铜钨钼矿床形成压力约为52.5Mpa,形成深度约为1.9km,形成于较浅环境下。流体包裹体气相成分主要为CO₂、CH₄和H₂O蒸汽,液相成分主要为H₂O。其中第一、二次形成石榴子石矽卡岩的热液气相成分以CO₂和H₂O蒸汽为主;第三次形成磁铁矿和石英的热液气相成分出现CH₄、CO₂及H₂O蒸汽共存现象;第四次形成无矿石英脉的热液气相成分以CH₄和H₂O蒸汽为主;第五次形成黄铜矿与辉钼矿的热液气相成分为CH₄和微量的H₂O蒸汽;第六次形成石英—硫化物脉的热液气相成分以CH₄和H₂O蒸汽为主;第七次形成无矿石英脉的热液气相成分主要为CO₂和H₂O蒸汽;第八次形成方解石脉的热液气相成分以H₂O蒸汽为主,既不出现CH₄,亦不出现CO₂。其中与金属氧化物形成相关的热液气相成分为CH₄、CO₂及H₂O蒸汽共存。而与金属硫化物形成相关的热液气相成分以CH₄和H₂O蒸汽为主。可推测是由于金属氧化物形成后CO₂大量逸出,导致氧逸度降低,硫逸度相对升高,从而导致了硫化物的大量沉淀。各次热液活动形成的矿物中流体包裹体均一温度、盐度及成分有重叠部分,表明后期热液活动会对早期矿物中流体包裹体的温度、盐度和成分产生一定影响。