中共中央、国务院于2018年印发《乡村振兴战略规划(2018-2022年)》,作为第一个关于乡村振兴的五年计划,再次将“三农”问题提到了高度重视的战略地位。农村信用社作为农村金融的主力军,在支持农村地区相关事业的发展、提供金融服务的过程中发挥着重要作用,然而,产权不清晰、法人治理结构不完善等一系列问题的存在一直制约着农村信用社的发展。为解决农村信用社长期亏损的局面使其更好地服务“三农,”2003年国务院启动了针对农村信用社的新一轮改革。随着农村信用社逐步改制为股份制的农村商业银行,如何合理地配置股权结构也成为了随之而来的新的问题。目前针对农村商业银行内部治理机制的研究大部分只是聚焦于股权结构与农村商业银行绩效二者的表面联系上,较少深入研究股权结构对经营绩效影响的具体路径。近年来,有学者发现股权结构会显著影响商业银行的代理成本,进而影响商业银行的经营绩效,并且股权结构对经营绩效作用过程的实现会受到制度环境的影响。因此,本文相继引入中介变量代理成本与调节变量制度环境,实证研究股权结构对农村商业银行经营绩效的影响以及具体作用路径。首先,本文在归纳总结相关文献的基础上结合现状情况,研究了股权结构对农村商业银行绩效的影响机理,以及代理成本发挥中介效应和制度环境发挥调节效应的作用机理,据此提出研究假设。其次,构建回归模型,利用统计分析软件对全国41家不同省份地区的农村商业银行2012年—2018年的年报数据进行实证分析,并得出以下结论:股权集中度与农村商业银行绩效呈显著正相关关系;股权性质与农村商业银行绩效呈显著负相关;两类代理成本在股权结构与农村商业银行绩效之间存在部分中介效应;制度环境显著负向调节股权集中度对农村商业银行绩效的正向影响,且制度环境的调节效应部分通过中介变量代理成本起作用;制度环境显著正向调节股权性质对农村商业银行绩效的负向影响,且制度环境的调节效应部分中介变量通过代理成本作用。最后,根据实证结果,从优化股权结构、提高自身治理水平、推动制度环境建设等方面提出对策建议。