奶牛乳房炎又称奶牛乳腺炎（Bovine mastitis）,该病以多种病原微生物感染为主要发病原因,发生范围广且发病率高。在治疗领域中,国内外仍以抗生素为主,这样大剂量盲目地使用抗生素不仅存在一定的食品安全隐患,更危害人类的饮食健康。本研究以上海光明10家奶牛场为本实验的研究基础,采用PCR技术鉴定上海光明引起奶牛乳房炎的主要致病菌,通过耐药性分析,制定上海光明奶牛乳房炎的用药指南。另选取发病率较高的6家中患临床型乳房炎的奶牛为实验对象,鉴定其牛床垫料及相对应的奶样体细胞,探索各奶牛场患临床型乳房炎各致病菌之间的流行性和完善奶牛场对牛床垫料的管理;旨在获得上海光明乳房炎致病菌及其对药物的敏感性、临床型乳房炎致病菌之间的流行性,为指导牧场在奶牛乳房炎防治中能合理地用药提供切实地理论依据,同时也为系统开展奶牛养殖行业关于乳房炎致病菌的分子流行病学调查及其耐药性研究奠定了基础,研究内容包括以下三个部分:（1）乳房炎致病菌PCR鉴定及流行性分析。本实验利用三重荧光定量PCR的方法,对上海10家牧场186份缸样和796份个体样进行了细菌鉴定,其中2018年缸样检出率为40.7%,个体样检出率为42.3%。2019年缸样检出率为60.3%,个体样检出率为60.9%。两年中,无论是奶缸样品还是个体样品,检出率最高的都是克雷伯氏菌属,最高检出率可达85.1%,其次无乳链球菌和大肠杆菌也均有大幅度升高。（2）奶牛乳房炎主要致病菌的耐药性分析。利用PCR实验结果对上海4家牧场5种主要致病菌进行分离和纯化,共计49株致病菌。主要包括大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、克雷伯氏菌属、停乳链球菌及无乳链球菌。药敏结果表明,在10种药物中,对致病菌敏感度较低的有四环素、卡那霉素、链霉素、青霉素和庆大霉素,而头孢噻肟、环丙沙星和恩诺沙星对5种致病菌有良好的敏感性。（3）临床型乳房炎致病菌与体细胞间关联性分析。为了更直观地反映牧场乳房炎的发病问题及治疗情况,本研究通过奶样和牛床垫料进行细菌鉴定结合牧场体细胞数据的方法,探寻两者之间的相关性。结果发现即使是同一牧场,其临床型乳房炎奶牛患病乳区体细胞也存在很大差异。环境性致病菌大肠杆菌、克雷伯氏菌属、绿脓杆菌和β-内酰胺酶抗性基因在各牧场临床型乳房炎奶样和卧床垫料中检出的流行率基本一致,存在较强关联性。