随着国务院办公厅2017年发布《人力资源社会保障部财政部国家卫生计生委国家中医药管理局关于开展公立医院薪酬制度改革试点工作的指导意见》等一系列最新医改政策,未来公立医院薪酬改革是将医院职工收入与药品、检查费用等收入脱钩,建立健全符合行业特点的人事薪酬制度。新医改背景下,公立医院应如何进行自身的发展,又如何平衡医院经营效率与维护公益性两者的关系?目前,M医院科室现行绩效评价仍侧重财务指标,并不符合新医改要求,医院自身发展进入瓶颈期。为有效解决M医院科室绩效评价存在的问题,本文借鉴平衡计分卡理论为M医院科室建立新型绩效评价体系,明确了论文研究意义与价值。本文以平衡计分卡绩效评价理论为研究出发点,首先对传统绩效评价理论及平衡计分卡的相关概念做了介绍,并结合M医院科室现行绩效评价方法存在的缺陷,进一步分析了其采用平衡计分卡的可行性和必要性。M医院科室具备实施平衡计分卡的基本条件,而后根据M医院科室的战略目标、运营状况和实地的调查问卷,并参考现行的指标体系,通过统计分析研究各指标之间的联系,将各指标进行重要性排序,为M医院科室设计基于平衡计分卡的绩效评价指标体系。同时帮助M医院科室将战略目标转化成具体行动,提高自身竞争力。接着利用层次分析法计算出了各个维度及各个指标的权重,其中对于指标重要程度的判断采用调查问卷和走访的形式确定。根据所得权重,采用较为常用的模糊综合评价法计算出M医院科室平衡计分卡各个维度及总体绩效评价的结果。并与现行绩效评价结果做了对比。通过对比分析,得出了采用平衡计分卡进行绩效评价更有利于M医院科室发展的结论,同时对M医院科室实施平衡计分卡的保障机制进行简单分析。最后的研究结论对M医院科室实施平衡计分卡的必要性进行分析,并指出实施平衡计分卡能促进M医院发挥其社会使命突出其公益性特点,制定更加符合自身发展的战略,从而使绩效评价更加科学合理。