产学研合作作为一种重要的创新机制,具有实现资源共享、优势互补、风险分散、研发效率提高等作用,推动了我国的科技进步与自主创新。加强和创新产学研合作模式,是地方政府转变职能,发挥服务型政府功能的一项重要手段。泉州市院士专家工作站作为新型的产学研合作模式,在促进科技成果产业化、培养企业创新人才、推动产业转型升级等方面发挥了有效作用。随着泉州市院士专家工作站发展规模的壮大,工作站运行主体间的矛盾越来越明显,运行过程中逐渐暴露出种种弊端,极大地制约了工作站的健康发展和可持续发展。本文在对泉州市院士专家工作站发展现状进行跟踪调研的基础上,试图通过对工作站运行过程中出现的矛盾与冲突进行深入分析,探讨工作站现有的治理困境和治理对策。传统的政府主导型治理模式存在着明显不足和缺陷,要求我们积极地探索有效的治理策略来解决这些问题。只有在协作治理模式下,引入企业和院士团队等其他治理主体,多方主体合作进行治理,才能有效解决泉州市院士专家工作站存在的问题。