建立定量乙酰化蛋白质组的质谱分析方法

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人们已经发现包括甲基化、乙酰化、糖基化、磷酸化在内的超过200种不同类型的蛋白质翻译后修饰(PTM),其中许多修饰的异常调节与细胞衰老和疾病如癌症、心血管疾病等密切相关。研究它们的多样性对于理解疾病发生机制乃至发现药物治疗靶点非常重要。尽管有证据阐明这些修饰的蛋白会影响细胞功能,但是由于研究方法的限制,仍然还有大量修饰的底物和修饰位点是不清楚的。因而对现有的研究方法不断改进和创新是十分有必要的。  乙酰化修饰是细胞生物调节蛋白质发挥生物学功能的重要翻译后修饰。大量的研究发现,乙酰化在控制细胞代谢[1]、蛋白折叠、姊妹染色单体的结合中起着重要作用。还发现乙酰化具有调节热量限制的有利效果,即延缓衰老的不用绝食的低营养摄入[2]。研究也证明乙酰化的功能角色从酵母到哺乳动物都是进化上保守的。  酿酒酵母是一种广泛应用于研究的模式生物,它含有一些进化上保守的赖氨酸乙酰化转移酶和去乙酰化酶,因此非常适合作为乙酰化修饰的研究对象。本研究不仅有助于发现乙酰化修饰在应激反应和代谢调控中扮演的角色,而且还将有助于深入研究乙酰化修饰在诸如肿瘤等疾病发生发展中的重要作用,并有助于发现新的药物治疗靶点以及研制抗肿瘤药物,如最近报道的FDA批准上市的Ⅰ型组蛋白去乙酰化酶口服抑制剂西达苯胺[3]。  本课题针对乙酰化修饰,优化了样品制备和数据分析流程,建立了基于酵母体系的双甲基标记定量乙酰化蛋白质组的分析流程,总共鉴定到362个高度可信的乙酰化蛋白以及846个乙酰化位点。并且在两个菌株定量比较中发现了3个显著差异表达的乙酰化蛋白和修饰位点,分别是PAA1的K176,ENO1的K346,SSE2的K627。进一步的研究将有助于阐明这三个乙酰化位点在酵母体内的功能。图15幅,表4个,参考文献99篇。
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