四川锦葵(Malva parviflora)上双生病毒的鉴定及变异分析

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在植物病毒中,双生病毒是唯一一类具有孪生颗粒形态的单链环状DNA病毒,多发生在热带和亚热带地区。根据昆虫介体、基因组结构和寄主范围的不同,双生病毒科可划分为四个属:菜豆金色花叶病毒属(Begomovirus)、甜菜曲顶病毒属(Curtovirus)、玉米线条病毒属(Mastrevirus)及番茄伪曲顶病毒属(Topocuvirus)。其中,菜豆金色花叶病毒属病毒在自然状态下可由烟粉虱以持久性方式传播,因此该属病毒也称作粉虱传双生病毒(Whitefly-transmitted geminivirus, WTG)。该属病毒分布广泛,危害严重,至今已给39个国家的作物生产造成了毁灭性灾害。近年来,在我国云南、海南、广东、广西和福建等省的烟草、番茄、番木瓜等作物和杂草上相继发现了多种双生病毒。由于四川省已有双生病毒侵染番茄、辣椒等经济作物和赛葵等杂草的报道,鉴于杂草是双生病毒的重要中间寄主和初侵染源,为了明确四川锦葵上双生病毒的种类,本文对四川锦葵黄脉病的病原进行了分子鉴定,并对其基因组结构及变异进行了分析。2010年,我们在四川攀枝花地区采集了10份表现明显黄脉症状的锦葵样品,利用双生病毒通用引物PA和PB,对锦葵样本进行PCR检测,结果发现:10份样品中有9份扩增出约500bp的条带(样品SC193未扩增到),说明这些杂草上存在双生病毒侵染。选取部分样品进行RCA-PCR后,SC193也扩增到500bp片段,说明10份样品都受到双生病毒侵染。PCR产物测序后进行序列比较表明,这些样品可能受两种双生病毒侵染,即:中国番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl China virus, TYLCCNV)和云南赛葵黄脉病毒(Malvastrum yellow vein Yunnan virus, MYVYNV)。在此基础上,任选样品SC176、SC224和SC226对其全基因组进行了扩增。其中,SC176和SC226-1的DNA-A全序列分析结果表明:SC176和SC226-1全长分别为2737bp和2738bp,具有典型的双生病毒DNA-A基因组结构;序列比较分析发现,两者之间相似性为96.9%,且均与TYLCCNV的分离物TYLCCNV-TbY25相似性最高,分别为98.2%和97.1%;说明它们是TYLCCNV的不同分离物。对SC224和SC226-2的DNA-A进行全序列测定,结果表明:SC224和SC226-2全长分别为2747bp和2748bp,具有典型的双生病毒DNA-A基因组结构;两者之间序列相似性为99.2%,均与MYVYNV的相似性最高,分别为99.0%和99.3%;表明它们是MYVYNV的不同分离物。利用扩增双生病毒卫星DNAβ的特异性引物Beta01和Beta02,从样品SC176、SC224和SC226中均扩增到约1300bp的条带。序列分析表明:SC224β和SC226β全长分别为1356bp和1350bp,两者之间相似性为99.0%,且均与MYVYNV伴随的DNAβ(MYVYNB)相似性最高,分别为99.0%和99.1%。SC176β全长为1335bp,与TYLCCNV伴随的DNAβ(TYLCCNB)相似性最高为85.8%。这些结果表明,样品SC176受TYLCCNV单独侵染;样品SC224受MYVYNV单独侵染;样品SC226受TYLCCNV和MYVYNV两种病毒复合侵染;且样品中存在两类卫星DNAβ分子,分别是MYVYNB及TYLCCNB。利用TYLCCNV和MYVYNV的特异引物分别对10份锦葵样品进行PCR检测,结果表明:10份样品中有7份样品能检测到TYLCCNV和MYVYNV两种病毒复合侵染,复合侵染率高达70%,其它3份分别受TYLCCNV或MYVYNV的单独侵染,可见田间自然发生的双生病毒复合侵染现象十分普遍。
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