【摘 要】
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人类基因组计划是生命科学领域最宏伟的工程.基因组功能预测包括基因组组成元素的识别、ORF功能预测、代谢途径和调控网络的重构和比较等层次.基因组功能预测的第一步是识别
【机 构】
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中国科学院上海生物化学和细胞生物学研究所
【出 处】
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中国科学院上海生物化学研究所 中国科学院上海生物化学和细胞生物学研究所 中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学
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人类基因组计划是生命科学领域最宏伟的工程.基因组功能预测包括基因组组成元素的识别、ORF功能预测、代谢途径和调控网络的重构和比较等层次.基因组功能预测的第一步是识别出基因组成元素,包括编码区和非编码区两大类.原核ORF的识别已经达到很高的准确率;而真核生物由于基因组异质性很大,提高ORF识别率仍然是一个具有挑战性的课题.ORF功能预测是目前基因组功能预测的核心问题.序列水平的生物信息学方法有多种,包括最大序列相似性搜索、模体搜索、COG方法、进化分析方法,进化印记方法等.代谢途径和调控网络的构建与比较是基因组功能预测的高层次内容.以蛋白质蛋白质相互作用为代表的生物活性分子之间的相互作用是生命活动的基础,该领域的研究是沟通基因型与表现型的关键环节.基因组序列信息和表达信息是构建代谢途径和调控网络的主要依据.
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