艾滋病(AIDS，获得性免疫缺陷综合症)，其病原体为人免疫缺陷病毒(humanimmunodeficiency vires，HIV)，是20世纪危害人类健康和生命最严重的疾病之一，它极大的影响了人类的健康。寻找新的抗HIV的药物一直是研究的热门课题。目前科学家正在努力寻找发现抑制和治疗艾滋病的有效方法。 HIV蛋白酶归属于天冬氨酰基蛋白酶，由两条含99个氨基酸的多肽链形成的C<，2>对称的均二聚体，每一亚基上天冬氨酰残基形成了酶的活性中心。HIV蛋白酶(HIV PR)对该病毒复制周期正常运转和病毒成熟至关重要，是病毒复制必需的酶，是抗HIV的药物重要靶点。 因此，为了寻找更加有效和低毒的抗HIV蛋白酶的活性化合物，我做了如下工作： (1)利用现代化学信息学手段和中药化学数据库寻找新的抗HIV药物。选用现有的抗HIV的药物沙奎那韦(Saquinavir)作模版，对中药分子数据库进行相似性搜索，然后采用分子对接方法得到HIV-1蛋白酶受体与亚叶酸的合理复合物结构，用分子动力学方法对对接结果分别进行了无水存在200ps和有水存在50ps的模拟。根据数据库搜索和对接结果，分子亚叶酸可以作为药物开发的起点。通过分析数据，可以了解配体各个区域与受体相互作用的细节和变化规律。 (2)利用现有的抗病毒药物采用对接方法筛选全部HIV受体蛋白酶，然后用选出的较优蛋白酶受体针对中药数据库进行筛选。根据数据库筛选和对接，选出可能的抗HIV的中药蘑菇氨酸，并对该中药进行改造。实验得出的中药分子的改造规律将有助于其他可能的抗HIV的中药的修饰与改造。