【摘 要】
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表观遗传学是指当DNA序列不发生改变时,发生的能够遗传的亲代与子代间的信息传递。包括DNA甲基化(DNA methylation)、组蛋白乙酰化(Covalent histone modification)、RNA甲基化(RNA methylation)等等。同样,RNA上有许多化学修饰,普遍存在于真核生物中,这些修饰以前被认为是静态的,不可逆的。目前为止,已经有超过100多种的RNA修饰被发现,
【基金项目】
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“国家自然科学基金”(项目编号:31771601和31371478);
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表观遗传学是指当DNA序列不发生改变时,发生的能够遗传的亲代与子代间的信息传递。包括DNA甲基化(DNA methylation)、组蛋白乙酰化(Covalent histone modification)、RNA甲基化(RNA methylation)等等。同样,RNA上有许多化学修饰,普遍存在于真核生物中,这些修饰以前被认为是静态的,不可逆的。目前为止,已经有超过100多种的RNA修饰被发现,很大程度上丰富了RNA的功能和遗传信息的多样性。作为第一个乙酰化的核苷,RNA乙酰化(ac4C)也被发现在m RNA上广泛存在,仅次于m7G、m6A和f5C。RNA乙酰化同样是一种表观遗传修饰,自首次于1966年在酵母t RNA中发现了ac4C,ac4C修饰又先后在r RNA和m RNA中被发现,也被证实为一种广泛存在的RNA的修饰。ac4C修饰在RNA中具有多种作用,比如在t RNA上的存在有助于提高蛋白质翻译的高保真度,在m RNA上的表达对m RNA的稳定性和蛋白质翻译效率具有显著的促进作用。其中N-acetyltransferase 10(NAT10)作为目前唯一已知的乙酰化转移酶在各种调控机制中具有重要的作用。但目前尚未确切明确NAT10在癌症中的具体作用与功能。本课题以HCT116细胞为实验材料,以生物信息学数据为支撑,分析了NAT10在泛癌中表达情况以及相关通路和互作网络,以及NAT10与结肠癌的发生发展、预后以及转移的相关性,利用已有的临床样本作为验证,通过设计特异性的sg RNA,构建Cas9重组载体,利用CRISPR-Cas9技术对其进行敲除,同时检测NAT10敲除效率以及sg RNA的脱靶情况,进而对NAT10对细胞生物学特性的影响进行探究。初步揭示了NAT10对结肠癌细胞生物学行为的影响。
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