微生物广泛分布于海洋环境中,在海洋生态系统中起着重要作用。但由于所处环境的特殊性,海洋微生物的研究相对较少,而海洋真菌相较于细菌和古细菌而言,关注更少。本论文以深圳湾为研究对象,采用荧光定量PCR(Q-PCR)、Illumina Miseq高通量测序技术以及真菌分离培养技术对深圳湾沉积物的真菌多样性、群落结构及生态分布特征进行分析。以ITS2为目的基因,通过高通量测序获得到有效序列1,084,873条,以97%相似度水平划分OTU,共得到1,370个OTUs,其中572个(43.97%)可以精确到门水平,376个(28.90%)可以精确到纲水平,245个(18.83%)可以精确到属水平,共鉴定出5门、18纲和161属。以某个门在所有样品中相对丰度的平均值大于1%确定关键门为子囊菌门Ascomycota和担子菌门Basidiomycota,这两个门的真菌在相对丰度上占绝对优势,分别为47.5%和32.7%。以某个属在所有样品中相对丰度的平均值大于1%确定关键属,发现深圳湾沉积物样品中真菌关键属包括子囊菌门和担子菌门的10个属,分别为:季也蒙毕赤酵母属Meyerozyma,木霉属 Trichoderma,踝节菌属Talaromyces,丝孢菌属 Scedosporium,枝孢属 Cladosporium,Paraphaeosphaeria,Paraconiothyrium,Roussoell 和Cystobasidium。这些关键属可进一步归类于4个子囊菌纲:酵母纲Saccharomycetes,粪壳菌纲 Sordariomycetes,散囊菌纲 Eurotiomycetes,座囊菌纲Dothideomycetes和1个担子菌门囊担菌纲Cystobasidiomycetes。通过荧光定量PCR发现深圳湾沉积物真菌ITS rRNA基因的拷贝数在1.85±0.32×104到1.10=0.07×106 copies/g 沉积物之间。通过分离培养的方法从前述站点的10个站位个样品中分离到92株真菌,序列比对结果表明属于6个纲(25个属):散囊菌纲Eurotiomycetes,座囊菌纲Dothideomycetes,粪壳菌纲 Sordariomycetes,酵母纲 Saccharomycetes,伞菌纲Agaricomycetes和微球黑粉菌纲Microbotryomycetes。分离获得的优势属是季也蒙毕赤酵母属,青霉属和曲霉属,占到分离真菌菌株总数的40%以上。所有分离获得的真菌都属于子囊菌门和担子菌门,并且子囊菌门占优势地位。通过分离培养方法发现的6个真菌纲中在免培养方法的研究中都有发现,且两种方法共同发现的13个真菌属,占到分离培养方法获得真菌菌属总数的50%以上。对深圳湾沉积物真菌的多样性研究表明,海洋环境中存在丰富的真菌资源,有很多未知真菌有待发现。本研究有助于加强对海洋环境真菌多样性和群落结构的认识,为海洋真菌资源的开发和利用,以及研究真菌在整个海洋生态系统中作用提供相关的基础理论支持。