随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。蛋白质是生理功能的执行者,是生命现象的直接体现者,对蛋白质结构和功能的研究将直接阐明生命在生理或病理条件下的变化机制。基于质谱的定量蛋白质组也应用的越来越广泛,包括差异蛋白质的测定也是其中最重要的一环。如何运用质谱来测定蛋白质的差异表达量成为众多研究者的核心研究问题。目前国际上已有一些基于质谱的定量蛋白质组的软件,但是因为质谱的多样性以及实验的多样性,很多都不能直接应用到国内的实验室来,而且以上的软件对于质谱精度的识别问题也没有进行改进。针对于国内实验室的需求,以及针对质谱精度,运用各种算法,开发了一套蛋白质组定量软件Quant,而且针对于定量蛋白质组以后的发展趋势提供了很好的接口,同时,与国际上广泛使用的软件进行了比较以及测试评估,这套蛋白质组定量软件表现出了较高的精度和准确率。