用单分子方法研究解旋酶与G4 DNA的作用机理

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sjty2j
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
解旋酶(Helicase)是一类通过水解三磷酸核苷(通常是三磷酸腺苷(ATP))打开核酸之间氢键的马达蛋白。其广泛存在于每个物种中并且几乎参与了核酸代谢的各个方面。解旋酶突变将会导致核酸代谢紊乱,甚至会导致严重的遗传性疾病,如人类RecQ家族解旋酶RecQ2/Bloom(BLM)、RecQ3/Werner(WRN)、RecQ4/RTS突变将会分别导致BLM综合征、WRN综合征和Rothmund-Thomson综合征。这些病人通常表现为基因组不稳定及易患癌症。解旋酶不仅可以解旋传统的双链结构,还可以解旋Holliday连接体、G-四链体(G-quadruplex,G4)等复杂结构。G4是一类非常规的核酸高级结构。其基本组成单元是四个鸟苷酸通过Hoogsteen氢键形成的平面。当不少于两个鸟苷酸平面被Na+或K+稳定,就形成了G4。G4 DNA在复制、转录、端粒代谢等生物过程中都发挥了极其重要的作用,所以如果G4不能被正确处理将会导致各种疾病。G4的生物功能是通过动态的折叠和打开实现的。在细胞内,G4可以自发折叠,但其打开是由专门的解旋酶来完成的,例如Pif1、FancJ、BLM、WRN等。在体外理解这类解旋酶解旋G4 DNA的机制以及G4 DNA对这类解旋酶的影响有助于预测其在体内的行为,然后了解它们的生物功能。但由于研究手段的限制,解旋酶与G4 DNA相互作用的分子机理尚不清楚。近二十年来,单分子技术(例如光镊、磁镊、单分子荧光共振能量转移)的进步极大地提升了我们实时观察解旋酶与核酸相互作用的能力。本文利用单分子荧光共振能量转移技术的优势,系统地探究了解旋酶Pif1、BLM和WRN与G4 DNA的相互作用,揭示了前所未有的反应细节。Pif1与G4 DNA相互作用的实验结果表明:(1)Pif1以位移的方式分步并且往复打开G4 DNA;(2)Pif1往复打开G4受到ATP浓度的调节;(3)Pif1往复打开G4不需要5’尾链;(4)Pif1以单体形式打开G4;(5)G-三链体在Pif1往复打开G4过程中发挥重要作用;(6)高浓度Pif1解旋双链DNA前表现出短暂停顿的现象,对应着Pif1同源二聚体的形成;(7)G4可以明显缩短Pif1解旋双链DNA的等待时间;(8)G4促进解旋的现象在复制叉处表现的更为明显;(9)更高浓度的Pif1通过加快二聚化减少等待时间;(10)富含G的序列而不是G4结构促进Pif1解旋下游双链。BLM与G4 DNA相互作用的实验结果表明:(1)G4 DNA在生理条件下可以折叠成两种结构,并且Mg2+也可以稳定G4结构;(2)BLM解旋G4是依赖于ATP的;(3)当G4 3’末端只含有单链DNA的情况下,BLM分步阶梯式以G-三链体、G-发卡结构为中间状态打开G4 DNA;(4)当G4 3’端通过一段单链DNA连接双链DNA的情况下,BLM锚定在单双链叉口抽动单链DNA,挤出单链DNA环,循环打开G4 DNA;(5)BLM打开G4结构的能力较弱,不能打开稳定的四层G4结构,同时G4是BLM位移的障碍。WRN与G4 DNA相互作用的实验结果表明:(1)WRN在叉状、单双链和含有G4的DNA结构上表现出循环解旋现象,显示出表观持续解旋能力弱;(2)WRN可以锚定在单双链叉口抽动5’单链DNA,诱导单链DNA往复成环;(3)循环解旋来自相同WRN沿着同一条单链DNA的往复运动,而不是不同解旋酶的解离和结合,或相同解旋酶的链转换;(4)G4在不同结构环境下均表现出阻挡WRN位移和解旋下游双链的现象;(5)G4序列的互补链或G4 3’端多出的双链锚定位点可以促进WRN解旋G4下游的双链DNA。总之,上述解旋酶解旋G4过程中均表现出分步解旋和循环解旋的现象但分子机理不同。而对于不同的解旋酶来说,G4对于下游双链DNA解旋的影响有时表现为激活有时表现出抑制。
其他文献
目的:探讨蒙脱石散和沙利度胺治疗复发性口腔溃疡的疗效。方法选取我院2013年1月~2014年1月收治的复发性口腔溃疡患者150例作为研究对象,随机分为治疗组和对照组,各75例,分别进行
目的:对微型种植体支抗在口腔正畸治疗中的应用效果进行探讨。方法选取我院2014年3月~2015年1月需进行正畸治疗的口腔科患者48例进行研究,并根据治疗方法的不同分成对照组(行常规
自20世纪90年代以来,新闻策划作为新闻产品生产链中的一个重要前置环节,越来越为新闻业界所重视。新闻策划需要在遵循新闻真实性原则的基础上追求新闻报道的出新出彩,是一项既要
习近平总书记曾在1990年《秘书工作的风范——与地县办公室干部谈心》一文中,对办公室工作做出了详尽的阐述和深刻的论断。习近平总书记谈话中对办公室工作的阐释,比如办公室工
报纸
目的:探究他克莫司软膏治疗口腔扁平苔藓的短期疗效及安全性。方法选择2012年6月~2014年6月我院收治的口腔扁平苔藓患者70例作为研究对象,随机将其分为实验组和对照组,各35例。实
《红楼梦》的文本语符是极为复杂的。其话语范式具有多义性、开放性、隐喻性等突出特点。这类话语总是同时兼具诗性、史性与思性三个向度,与追求话语单义性、闭合性、体系性的
加强和改进新形势下思想作风建设,是推进部队党的建设一项重大而紧迫的任务。要进一步提高思想认识,切实认清加强和改进新形势下思想作风建设的重大意义及现实紧迫性;真正吃
目的分析坚固内固定加颌间牵引治疗颌骨骨折的疗效。方法选取我院2012年5月-2015年5月收治的颌骨骨折患者90例为研究对象,将其随机分为试验组和对照组,各45例。患者均行坚固
介绍H0 8Mn2SiA冷拔钢丝退火后形成的“花丝”现象对成品焊丝的危害。分析认为形成“花丝”的原因是半成品在退火时由于炉温过高及炉内富氧造成氧化烧损、酸洗后的钢丝表面粗
写作是语言使用的基本技能之一。在多年的英语语言教学中,作为一线教师,我们深感写作教学的艰难和迷茫。国内所广泛使用的写作教学方法包括成果法、过程法、体裁法等,对各种