Pex14磷酸化修饰参与毕赤酵母过氧化物酶体自噬的机理研究

来源 :山东师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bfxbfxabc
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
过氧化物酶体(peroxisome)是由单层膜包被的细胞器,普遍存在于真核生物的细胞中。过氧化物酶体内含有多种酶,参与多种代谢途径,主要参与脂肪酸的β氧化以及自由基的清除。细胞环境对过氧化物酶体的形态、数量以及功能有很大影响。细胞通过调控过氧化物酶体生物发生和降解之间的平衡得以实现过氧化物酶体的稳态,过氧化物酶体的分裂、增殖、传承以及蛋白转运等细胞过程被称为过氧化物酶体的生物发生;冗余或受损的过氧化物酶体的选择性降解过程被称为过氧化物酶体自噬。过氧化物酶体的自噬主要包括过氧化物酶体微自噬和过氧化物酶体巨自噬两种形式。Pex14是过氧化物酶体膜上重要的蛋白,不仅参与过氧化物酶体的生物发生,还参与过氧化物酶体的自噬过程。Pex14是一种磷酸化蛋白,在毕赤酵母中以磷酸化和非磷酸化两种状态存在,但是磷酸化Pex14的激酶、Pex14蛋白的磷酸化位点及Pex14磷酸化对过氧化物酶体生物发生和自噬的影响等问题目前还不清楚。本实验利用毕赤酵母(Pichia pastoris)Pex14磷酸化突变体菌株,通过生长曲线测定、western blot检测、荧光显微观察、体外激酶活性实验、酵母双杂交以及Co-IP等实验方法来探究Pex14的磷酸化是否影响过氧化物酶体生物发生和自噬。主要研究结果如下:1.确定毕赤酵母中Pex14关键的磷酸化位点实验室前期工作对毕赤酵母Pex14进行了磷酸化质谱测序。在甲醇诱导条件下T288,T289,S292,S385位的氨基酸可能为Pex14的磷酸化位点。我们将Pex14(T288,289,S292A)、Pex14(T288,289,S292D)、Pex14(S385A)、Pex14(S385D)等磷酸化和非磷酸化突变整合到Δpex14菌株基因组中,分析Pex14的磷酸化突变体是否参与过氧化物酶体生物发生或自噬。我们通过western blot检测各突变菌株中Pex14的分子量大小,结果发现只有Pex14 S385D的分子量比未突变的Pex14大,从而确定S385为Pex14的关键磷酸化位点。2.Pex14磷酸化对过氧化物酶体生物发生和降解的影响2.1 Pex14磷酸化不参与过氧化物酶体的生物发生我们通过对各磷酸化位点突变菌株进行生长曲线测定,发现Pex14磷酸化突变并不影响菌株在甲醇培养基和油酸培养基中的正常生长,说明Pex14磷酸化不参与过氧化物酶的生物发生。2.2 Pex14磷酸化修饰影响过氧化物酶体微自噬诱导各磷酸化突变菌株发生过氧化物酶体微自噬,在生化水平上,利用western blot检测Aox的降解情况,同时通过GFP-Cleavage实验检测GFP-Aox等融合蛋白的降解情况。生化实验发现在过氧化物酶体微自噬条件下,Δpex14::Pex14(S385D)-His和Δpex14::Pex14(T288,289,S292D)-His菌株中Aox降解显著减缓,从而确定Pex14磷酸化修饰影响过氧化物酶体微自噬。但是细胞水平上通过荧光观察只是观察的单个细胞间的差异,Pex14(S385A)和Pex14(S385D)菌株间GFP-Aox进入液泡降解的差异不如在生化水平上明显。2.3 Pex14磷酸化修饰对过氧化物酶体巨自噬及非选择性自噬影响较小诱导各磷酸化突变菌株发生过氧化物酶体巨自噬,我们通过检测过氧化物酶体巨自噬中Aox降解、GFP-Cleavage实验检测GFP-Aox降解以及荧光显微观察GFP-Pmp20降解等实验,并没有观察到Pex14 S385D对过氧化物酶体巨自噬有明显的影响。我们又诱导各突变菌株发生非选择性自噬,通过检测Aox的降解情况,同样没有观察到Pex14 S385D对非选择性自噬有明显的影响。3.通过体外激酶实验寻找磷酸化Pex14的激酶经生物信息学软件预测,蛋白激酶Ck2和Gsk3可能磷酸化毕赤酵母Pex14位于385位的丝氨酸,所以我们构建了表达载体,纯化Ck2,Gsk3和Pex14蛋白,通过体外激酶活性实验检测Ck2和Gsk3是否能够磷酸化Pex14 S385。由于Gsk3在大肠杆菌BL21菌株中形成包涵体蛋白,未能纯化到可溶性Gsk3蛋白。目前,纯化得到了His-Ckα1、GSTPex14ΔN和GST-Pex14ΔNS385A蛋白,然后利用纯化的蛋白进行体外激酶实验,放射自显影结果中显示GST-Pex14ΔN、GST-Pex14ΔNS385A均有条带,说明Ckα1可以磷酸化Pex14,但S385可能不是唯一的Ck2磷酸化位点。后续实验中,我们拟构建进一步截短的Pex14蛋白,通过激酶活性实验确定S385是否为Ckα1的磷酸化位点。4.探究Pex14磷酸化影响过氧化物酶体自噬的分子机理由western blot结果,我们已经确定Pex14磷酸化修饰会减缓过氧化物酶体微自噬,为了探究Pex14磷酸化是否通过影响与Atg30的互作从而影响过氧化物酶体微自噬,我们又进行了酵母双杂交实验检测了两者之间的互作关系。将构建好的ATG30-p GADT7和PEX14-p GBKT7质粒共同转入酿酒酵母菌株AH109,结果显示Atg30和Pex14并不互作,可能由于在酵母双杂交体系中Atg30没有被正确的修饰。所以我们计划构建载体ZEOCIN-ATG30-GFP-p IB2,然后分别转入Δpex14::Pex14(S385A)-His、Δpex14::Pex14(S385D)-His、Δpex14::Pex14-His菌株,准备利用GFP-Trap进行Co-IP实验,进一步分析Pex14磷酸化是否通过影响与Atg30的互作从而影响过氧化物酶体微自噬。
其他文献
多样性导向合成由于能高效、快速的合成各种性质的有机小分子化合物,受到学术界的广泛关注。普通的Ugi反应是基于异腈对亚胺的1,2加成,而基于异腈对α,β-不饱和亚胺的1,4加成的Ugi反应鲜有报道,而本课题所研究的基于去芳构化的1,4加成类型的Ugi反应更是未见报道。通过去芳构化反应可以将平面结构的芳香化合物转化为官能团化的三维结构的化合物。因此,去芳构化策略常常用于复杂天然产物的全合成中。本论文首
学位
动作能力贯穿人的一生,是个体进行各种动作行为的具体表现。现有研究对健康体质、感觉机能、体重状态等影响因素进行研究,是为了更好的促进动作能力的发展、树立终身体育的意识,从而达到提高体质健康的最终目的。10-11岁处于儿童中晚期(6-11)与青春期(10-12至18-21岁)的交叉时期,在该时期内对小学生的动作能力进行合理的干预和指导,可以为小学生个体未来自觉进行体育锻炼打下良好的基础。体力活动不足已
学位
抑制素(Prohibitin,简称PHB)是调节许多信号通路的一种支架蛋白,化学探针是验证新分子靶标的发展和治疗效果的主要方法,可有助于降低生物靶标或目标途径的技术和生物风险,是药物发现项目中的探路者。本课题的目的就是开发新的PHB配体作为化学探针从而探索多种类型的细胞和生理条件下PHB对多个信号通道的功能。以文献中已确定的PHB配体化合物为母体结构,本论文设计并合成了三大类PHB配体,分别是苯磺
学位
子宫是孕育子代的重要器官,其正常生理功能的维持,对女性生育和健康具有重要意义。子宫的结构主要由上皮(腔上皮和腺上皮)、基质和肌层(环形肌和纵行肌)组成,其结构的完整性是保证子宫发挥正常生理功能的前提条件。RTCB是在后生动物中发现的一种RNA连接酶,近年来发现其还参于早期胚胎发育和抗体分泌等过程。但有关Rtcb在子宫中的作用迄今为止未见相关报道。本实验室的前期研究发现,Rtcb在胚胎围着床期子宫上
学位
德国小蠊(Blattella germanica)是常见的世界性卫生害虫之一,能够携带多种细菌、病毒及寄生虫卵,导致疾病的传播,其分泌物或死亡虫体还能导致严重的机体过敏。目前,利用昆虫病原真菌开发生物杀虫剂是德国小蠊防治极具前途的发展方向。球孢白僵菌(Beauveria bassiana)是广谱性昆虫内寄生真菌,被广泛运用于各种生物杀虫剂中,具有持效期长、不易引起抗药性、安全环保等特点。德国小蠊体
学位
动作能力是人体各种身体运动能力的具体表现形式,它是评定个体健康状况的重要指标,也同身体素质、身体机能等概念一样,是构成个体运动能力的要素之一。儿童青少年时期是个体发展过程中动作能力形成与发展的关键时期,在这一阶段合理发展儿童青少年的动作能力,可为个体日后运动能力的形成打下坚实的基础。国家教育部依据当前我国的发展状况,结合“核心素养”这一理论,提出了专门针对体育与健康学科的教育发展理论—体育核心素养
学位
冠心病是全球范围内导致死亡和残疾的主要原因之一。随着介入手段的发展,通过及时有效地恢复心肌血液灌注,可以减轻缺血导致的心肌损伤及坏死。然而,恢复血液再灌注本身也可进一步导致心肌细胞损伤甚至坏死。因此,寻求一种改善再灌注损伤的药物迫在眉睫。黄酮是公认的具有抗氧化活性的天然产物之一。黄酮类化合物的抗氧化活性及其他多种生物活性使其对心肌缺血再灌注损伤有一定保护作用。Anastatins A&B是含生草(
学位
密怀顺(密云区、怀柔区和顺义区)平原区地下水资源丰富,是北京市重要的供水水源区。由于过量开采地下水,地下水位持续下降,形成了大的降落漏斗。南水北调水源进京后,通过回补地下水,缓解了北京地区供水压力,同时也为涵养地下水资源提供了契机。本文以密怀顺平原区为研究对象,结合南水北调补水工程,利用FEFLOW软件构建平原区地下水数值模型,利用敏感性分析法分析影响研究区地下水动态变化的主导因素,在此基础上,提
学位
bHLH(basic Helix-Loop-Helix)转录因子是植物第二大转录因子家族,参与植物生长发育和激素调节等多个调控过程,其N-端含DNA识别与结合位点,约50%的bHLH转录因子N-端basic区含高度保守的H5-E9-R13序列,此为结合DNA不可缺少的结构;bHLH转录因子的C-端为螺旋-环-螺旋区域,约含40多个氨基酸。bHLH转录因子普遍被认为以二聚体的形式发挥功能。花生(Ar
学位
清华简为研究商周时期的历史提供了新的史料素材。本文围绕清华简的相关内容,以传世文献为依托,结合甲骨文、金文,重点选取了商周“籍田礼”问题、“文武受命”问题、“武王在位年数”问题进行深入研究。第一章对清华简《系年》和商周“籍田礼”问题进行研究。回顾了学界关于“籍田礼”问题的争论和清华简《系年》公布以来引发的新讨论。从文献中西周籍田礼的不同称谓出发,指出其不仅具有祭祀上帝的作用,也是周人重视民生的反映
学位