HER2/neu联合细胞表位的预测筛选、基因克隆、表达及鉴定

来源 :温州医学院 温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zbt_25
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目的:   1.预测表皮生长因子受体2(HER2/neu)的CTL和B细胞联合表位,为其单克隆抗体的制备,表位疫苗设计和相关免疫效应等研究提供理论依据。   2.综和多参数表位预测分析,筛选出3个CTL和B细胞联合表位多肽,分别构建含预测CTL和B细胞联合表位多肽的原核重组质粒,采用6个组氨酸标签(His.tag)表达联合表位蛋白,并用SDS-PAGE、Western Blot进行分析鉴定。   方法:   1.以HER2/neu的完整氨基酸序列为研究基础,用SOPMA、HNN、GOR三种方案分析比较HER2/neu二级结构,并用亲水性、极性、柔韧性、表面可及性和抗原性等多参数分析其B细胞优势表位,采用吴氏平均抗原指数对上述结果进行综合分析,预测HER2/neu的优势B细胞表位。采用SYFPEITHI超基序法结合多项式法,预测HER2/neu的HLA-A2及HLA-A24限制性CTL表位。筛选HER2/neu全长序列中吴氏抗原性指数较高且相临近B细胞和CTL,表位的肽段作为联合表位蛋白。   2.选取预测的CTL和B细胞联合表位多肽序列,按原核系统偏爱的氨基酸密码子优化,合成寡核苷酸引物,退火获得目的基因后克隆至原核表达载体pET32a(+)多克隆位点内。将重组载体转化E.coli BL21表达联合蛋白,并经SDS-PAGE、Western Blot分析鉴定。   结果:   1.SOPMA、GOR和HNN三种方法对HER2/neu二级结构的预测均表明,二级结构中柔性区域以无规卷曲为主,少见转角。B细胞表位可能位于其N端30~38,117~124,186~195,245~250,378~388,497~504,601~606,939~943,992~997,1106~1116,1121~1126,1140~1158,1166~1175,1225~1234,1240~1246区段。CTL表位可能位于106~114,141~149,153~161,369~377,398~406,411~419,442~450,457~465,460~468,466~474,653~661,654~662,665~673,666~674,799~807,828~836,1093~1101区段。CTL和B细胞联合表位位于106~125,369~388,456~474,633~662,962~979,1091~1117区段。   2.经酶切、PCR鉴定和核苷酸测序表明,成功构建了3个编码B细胞和CTL联合细胞表位的原核表达质粒,分别命名为:pET32a/HER2-106~125、pET32a/HER2-369~388和pET32a/HER2-962~979。经SDS-PAGE分析表明,在37℃1.0mM IPTG作用下诱导5h均能很好地表达目的蛋白,相对分子质量(Mr)约为20kDa,与预期Mr大小吻合;蛋白表达量均约占细菌总蛋白量的20%左右。经WesternBlot结果显示单一明显条带,与SDS-PAGE中位置吻合。用Ni-NTA树脂亲和层析法分别纯化得到表位联合蛋白,分别命名为:HER2-106~125、HER2-369~388和HER2-962~979和pET32a(+)空载体所表达的His蛋白,纯度均达95%以上。   结论:   1.预测并筛选了3个可能的HER2/neu B细胞和CTL联合细胞表位。   2.通过分子克隆分别成功构建了含CTL和B细胞联合表位的重组质粒pET32a/HER2-106~125,pET32a/HER2-369~388和pET32a/HER2-962~979在原核表达系统内分别高效表达了表位联合蛋白HER2-106~125、HER2-369~388和HER2-962~979通过亲和层析法得到了纯化的表位联合蛋白。为HER2/neu表位疫苗设计和相关免疫效应奠定了基础。
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