甘蓝型油菜遗传图谱的构建及农艺性状QTL定位

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甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是世界重要油料作物,构建一张永久高密度的遗传连锁图谱对推动油菜育种工作的发展将具有重大意义。本研究构建了甘蓝型油菜分子遗传图谱并进行重要农艺性状的QTL定位。主要结果如下: 1.以甘蓝型黑籽双低油菜P174和甘蓝型黄籽油菜GH06杂交衍生来的F2:6家系的188个株系为作图群体,构建了一张包含19个连锁群,300个标记位点的甘蓝型油菜遗传连锁图谱,包括202个SRAP标记、65个SSR标记,23个AFLP标记和10个TRAP标记,图谱总长度1248.5cM,标记间平均距离为4.16cM。连锁群长度变动在39.5(LG9)~109.2cM(LG1)之间,群内平均图距在1.80~14.20cM之间,LG12平均图距最大,LG6的平均图距最小。LG1包含的标记数最多,有56个;标记最少的连锁群(LG17、LG19)只有4个。在整个图谱上,存在图距大于20cM的空隙6个。 2.图谱上300个标记位点的基因型分离统计结果表明,有97个位点不符合孟德尔理论分离比(P<0.01),占32.33%;标记的分离分析发现,来源于两个亲本的标记座位在群体中分离比例接近,基本符合1:1的理论分离比,表明该图谱未出现严重的偏分离。本研究首次将SRAP及TRAP标记引入甘蓝型油菜遗传连锁图谱的构建,结果表明这两种标记在甘蓝型油菜遗传图谱的构建上是一种良好的标记系统。 3.利用该图谱,通过软件Windows QTL Cartographer V2.5的复合区间作图法对所考察甘蓝型油菜的种子含油量、蛋白质含量、皮壳率、种皮色泽、种皮木质素含量、千粒重及单株产量七个性状进行QTL定位研究。取LOD临界值为2.0,共获得QTLs位点三十一个,分别位于LG1、LG2、LG3、LG4、LG5、LG6、LG8、LG9、LG11、LG15、LG16十一个不同的连锁群上,单位点遗传贡献率3.51%~14.66%,其中贡献率大于10%的QTLs三个。三十一个QTLs的LOD值介于2.1~7.4之间。 1)与蛋白质含量有关的QTLs七个,命名Pro1~Pro7,位于LG1、LG4、LG8、LG11、LG15五个不同的连锁群上,LOD值介于2.1~7.4之间,单位点解释表型变异3.51%~14.66%,其中Pro7的遗传贡献率最大。Pro5和Pro6两个位点显示负的加性效应,其余五个位点均为正加性效应。 2)控制种子含油量的QTLs位点七个,命名Oil1~Oil7,分布于LG2、LG5、LG6、LG8、LG9五个不同的连锁群上,LOD值介于2.2~5.6之间,单位点解释表型变异3.73%~10.46%,Oil3对种子含油量的贡献率最大。七个位点中,Oil4和Oil5两个位点表现负加性效应,其余五个位点表现正加性效应。 3)单株产量共检测到六个QTLs:Spy1~Spy6。Spy1位于LG1上,解释表型变异3.92%,LOD值2.1;Spy6位于LG15上,解释表型变异4.74%,LOD值为2.5;Spy2和Spy3位于LG6上,LOD值分别为2.9、3.8,单位点解释表型变异6.21%、7.56%;Spy4和Spy5位于
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