牛LPL、HSL基因克隆、SNPs筛查及其与肉质性状的关联分析

来源 :中国农业科学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:leeannie222
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
脂蛋白脂肪酶(Lipoprotein lipase,LPL)和激素敏感脂肪酶(Hormone-sensitive Lipase,HSL)是影响脂肪代谢的关键酶,LPL、HSL基因被确定为肉质性状相关的重要候选基因。该论文试验分别以安格斯牛、海福特牛、夏洛莱牛、中国西门塔尔牛、秦川牛、鲁西牛、晋南牛、西门塔尔×蒙古牛8个牛群体共292份血样,1头安格斯牛的脂肪组织为材料,分别提取基因组DNA和RNA,运用生物信息学、同源克隆和RT-PCR技术,对牛脂蛋白脂酶(LPL)基因和激素敏感脂酶(HSL)基因的cDNA完全编码区序列进行了克隆、鉴定与序列分析;将LPL、HSL基因作为牛脂肪代谢相关肉质性状的候选基因,运用PCR-SSCP、PCR-RFLP和测序相结合的方法对两个基因的部分基因组DNA片段进行了SNPs检测,运用一般线性模型研究了其遗传变异与上述8个群体牛部分肉质性状的相关性,得到了如下结果:1)分离脂肪组织总RNA,利用RT-PCR技术克隆并鉴定了牛LPL、HSL基因的包含全长CDS的cDNA序列,HSL基因全长CDS被GenBank数据库收录,收录号EFl40760。进行了牛LPL、HSL基因蛋白质序列的推导和结构的初步分析。结果表明,牛LPL基因和HSL基因分别编码478个和756个氨基酸。2)利用PCR-SSCP技术及测序方法对牛LPL基因全部编码外显子Exon1—9及Intron1、HSL基因Exon8、Exon9的多态性位点进行了检测,发现LPL基因Exon2、5、6、8、9及Intron1上存在SNPs位点,其它外显子上未发现多态。多态位点分别为:LPL基因的第2外显子65位A→T,第5外显子182位A→G,第6外显子31位T→C,第8外显子12位G→A,第9外显子上共发现T→C、C→G、T→C、C→T四处突变,和一处杂合缺失突变,第1内含子上一处TTTGT缺失突变。3)对各个群体每个多态位点均进行了多态信息含量、杂合度、有效等位基因数及Hardy-weinberg平衡X~2检验,发现8个群体在各个位点的遗传变异多为中度多态(0.25<PIC<0.5),西门塔尔×蒙古牛在LPL-Intron1位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态,其它群体在各位点均处于Hardy-Weinberg平衡。4)利用PCR-RFLP技术研究了8个群体牛LPL基因Exon2 HinfⅠ-RFLP位点的多态性及Exon5 MspⅠ-RFLP位点的多态性。将各遗传变异位点与大理石花纹等级、眼肌面积、背膘性状进行统计关联分析,实验结果表明LPL-Exon2 HinfⅠ-RFLP位点BB基因型个体的眼肌面积显著高于AA和AB基因型。其他性状在各基因型间差异不显著。LPL-Exon5 MspⅠ-RFLP位点的多态性未能引起肌内脂肪含量(大理石花纹等级)和眼肌面积的显著变异,而BB基因型的背膘厚显著的低于AA、AB基因型。
其他文献
在高速发展的信息时代,数字化新时代的人才必须具备一定的信息技术能力,但是仅简单掌握信息技术的能力是远远不能满足信息社会发展的需求和要求,因此计算思维油然而生.高中的
随着新课程改革的推行,教育部门更加注重学生综合全面发展.高中体育属于重要的素质类学科,在高中体育教学中,田径教学属于重要环节,为了保证田径教学效果,将分组分层教学法运
提高粗饲料的有效利用率是反刍动物营养研究的热门课题。本研究通过一系列试验,以探究饲料组合提高瘤胃纤维消化的微生物生态效应。首先利用NaOH和NH4HCO3处理稻草,从化学成
纳米结构材料功能各异,本文选取纳米材料的微观结构、制作方法、材料的性能以及其应用途径等方面进行介绍.尤其会重点介绍陶瓷纳米材料,并总结纳米结构材料的特点和发展趋势.
试验以不同水平包被植物精油代替日粮中硫酸粘杆菌素,研究对断奶仔猪生长性能、肠道菌群、炎症反应、抗氧化性及肠道屏障功能的影响。试验选用200头,25日龄断奶,体重为7.23±
在英语学习中,学生能掌握好语法知识,以后在实际应用中才不容易犯错误.中学英语教学目的是通过听、说、读、写的训练,使学生获得英语基础知识和初步运用英语交际的能力.英语
期刊
作文课是小学生语文综合知识能力运用的实践课程.学生平时积累了那么多的好词好句有什么用?就是要用在我们学生的写作中,那怎么运用?怎样巧妙的运用?这就需要教师的指导.教师
本论文研究了枯草芽孢杆菌制剂替代抗生素对肉鹅的促生长作用及其可能的原因。试验采用单因子试验设计,选用1日龄杂交商品雏白鹅(皖西白鹅×川府白鹅)96只,随机分为空白对照组(基础日粮)、黄霉素对照组(黄霉素120g/t基础日粮)、试验Ⅰ组(枯草芽孢杆菌制剂250g/t基础日粮)和试验Ⅱ组(枯草芽孢杆菌制剂500g/t基础日粮)4个处理组,每个处理4个重复,每个重复6只雏鹅,枯草芽孢杆菌制剂中活菌数2×
建筑装饰是一门实践性、技术性很强的课程,目前建筑装饰课堂教学中存在理论与实践脱节,教学方法单一,学生厌学等现象,创新课堂教学,加强课堂教学改革,解决说教课堂弊病,让学
众所周知,写日记是引发小学生写作兴趣的一种极好的练笔方式.通过写日记能提高学生的写话能力,训练观察能力,发挥想象能力,培养创造意识,形成合作交流的学习氛围.兴趣是最好