近年来，我国采取积极的财政政策，加快了基础设施的建设，基本建设投资逐年增加，成为拉动经济增长的主要因素。但由于缺乏良好的工程项目内部控制，针对我国基本建设中存在着诸多问题，如投资决策失误导致巨额亏损、挪用资金、预决算超标等现象比比皆是，严重影响了投资效益。因此，在经济持续高速增长的当前时期，加强工程项目内部控制已成为当务之急。工程项目内部控制是工程项目自我调节和自我约束的内在机制，建立健全工程项目内部控制，对于防范工程项目建设中的差错与舞弊，提高资金使用效益，从源头上规范基本建设投资市场秩序，有着十分重要的现实意义。 本文参阅了大量的参考资料，分析了西方国家内部控制理论的演变过程以及我国内部控制研究成果，对内部控制相关概念、内部控制目标及构成要素等进行界定和总结，在此基础上，结合施工企业的特点和管理要求，对内部控制理论在施工企业的应用进行系统分析，提出了施工企业内部控制系统设计的基本思路和系统结构的构成，并对各控制子系统进行了阐述。然后借鉴COSO报告内部控制理论，对上海某建筑工程公司的内部控制现状进行了评估，并以此为基础重点对工程施工管理的内部控制进行了设计。设计主要包括招投标内部控制、大宗材料设备招标采购内部控制、包工包料工程招标内部控制、目标施工管理内部控制、合同管理内部控制、合同审批内部控制、项目管理内部控制。