Prediction and Characterization of a Cationic Arg

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抗菌肽(AMPs)被视为植物防御系统的一部分,是一种可抑制多种植物病原菌的活性物质。从细菌到植物,抗菌肽可以存在于所有形式的生命中。SM-985是从大刍草(Zea mays ssp. mexicana)cDNA文库中分离的阳离子抗菌肽。使用具有不同算法的计算预测服务器来筛选大刍草cDNA文库中的抗菌肽,并且预测结果表明,SM-985具有高概率为抗菌肽。SM-985是一种富含精氨酸的肽,由21个氨基酸组成(分子量:2671.06Da),作为抗菌肽其物理化学性质非常理想,净电荷(+8),疏水率23%,Boman指数5.19kcal/mol,等电点12.95。SM-985肽具有两亲性α-螺旋构象。SM-985对6种植物病原细菌具有抗菌活性,对革兰氏阳性指示菌Clavibacterfangii,C.michiganesisssp.michiganesis和B.subtilis168的MIC为8μM,MBC为16μM;SM-985对革兰氏阴性指示菌Pseudomonassyringaepv.tomatoDC3000,Ralstoniasolanacearum,Xanthomonascampestrispv.Holcicola,X.oryzaepv.oryzae和E.coliBL21的MIC分别为4μM,<4μM,<4μM,4μM和8μM,而MBC值分别为16μM,4μM,4μM,8μM和16μM。由于带有正电荷的氨基酸和带负电荷的细菌磷脂之间的相互作用,SM-985增加了细菌细胞膜的通透性。这种相互作用是通过用FITC-SM-985处理指示菌确定的,结果显示SM-985与细胞膜(无论是革兰氏阳性还是革兰氏阴性菌)都具有高亲和力。通过两次抗菌活性测定,确定FITC标签对SM-985的抗菌活性没有影响。用SM-985处理指示菌,扫描电镜和透射电镜图像显示其细胞膜被损伤,细胞溶解。体内抗菌活性测定结果表明,SM-985可预防由PstDC3000引起的番茄叶斑病感染,并且也可抑制由PstDC3000引起的本氏烟(N. betnhamiana)的HR反应。此外,SM-985表现出对氯化钙的敏感性,这是阳离子抗菌肽的共同特征。
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