巢湖鸭脂肪代谢相关基因SNPs与肉质性状的关联分析

来源 :安徽农业大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:fengxun1985
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禽类肉质嫩度和风味与其肌肉肌内脂肪含量密切相关。为研究安徽省地方品种巢湖鸭肉质生理和遗传特性,本试验以12周龄巢湖鸭为研究对象,索氏抽提法测定巢湖鸭胸、腿肌肌内脂肪含量,PCR-SSCP分析脂肪沉积相关候选基因ApoVLDL-Ⅱ、A-FABP、CYP7A1的遗传变异及其与肉质性状的相关性;同时采用RT-PCR技术检测各基因型间的表达差异,探讨表达量与肉质性状的关系。研究结果将为地方鸭脂肪性状候选分子标记开发提供参考依据。具体研究结果如下:1.巢湖鸭肉质性状分析分别测定巢湖鸭胸、腿肌IMF、PH、嫩度、失水率、胸、腿肌率等肉质性状指标。公鸭的腿肌IMF含量(1.75%±0.85%)与母鸭的(1.81%±0.85%)无显著差异(P>0.05),但公鸭的胸肌IMF含量(2.08%±0.69%)显著高于母鸭(1.74%±0.60%)(P<0.05);胸、腿肌的PH值在6.51-6.75之间,胸、腿肌的失水率在0.74%一0.78%之间,胸肌率和腿肌率在0.10%-0.14%之间;公鸭的胸、腿肌嫩度分别为12.41 kg±6.61kg和7.97 kg±8.46 kg,母鸭的胸、腿肌嫩度分别为12.72 kg±6.06 kg和18.10 kg±6.12kg,但公母鸭之间无显著差异(p>0.05)。2.巢湖鸭脂肪性状相关候选基因SNP位点基因ApoVLDL-Ⅱ在688位点检测到A→G突变,位于内含子1区域,群体分为MM、MH、HH型,基因型频率分别为0.57、0.36、0.07,在2723、2743位点检测到C→T和T→C突变,位于内含子3区域,群体分为CC、CT、TT型,基因型频率分为别0.59、0.34、0.07,此两位点的有效等位基因数为1.60、1.57,杂合度分别为0.38、0.36,多态信息含量分别为0.30、0.30,属于中度多态,均处于哈代-温伯格平衡状态(p>0.05)。基因A-FABP共检测到3个SNPs,分别为A321G、T944C、C1054T,均位于内含子1,321位点处产生3种基因型,分别命名为BB、BD、DD型,基因型频率分别为0.55、0.35、0.10,944和1054位点处产生2种基因型,分别命名为AA、AG型,基因型频率分别为0.26、0.74,两位点的有效等位基因数为1.66、1.88,杂合度分别为0.40、0.47,多态信息含量分别为0.32、0.36,属于中度多态,该群体在321位点偏离哈代—温伯格平衡状态(P<0.01),而在944和1054位点处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。基因CYP7A1在外显子1检测到一处C203T突变,产生两种基因型,分别命名为EE、EF型,基因型频率为0.89、0.11,该位点的有效等位基因数为1.12,杂合度为0.10,多态信息含量为0.09,属于低度多态,处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.051。3.巢湖鸭相关候选基因多态与表达量、肉质性状的关联分析基因ApoVLDL-Ⅱ各基因型的表达量无显著差异(P>0.05),HH型的胸肌1MF、腿肌IMF、胸肌嫩度和腿肌嫩度值均高于MM和型和MH型,公鸭的胸肌IMF显著高于母鸭(P>0.05),公鸭的腿肌嫩度极显著高于母鸭(P<0.01);TT型的腿肌IMF含量极显著高于CC型和CT型(P<0.01),TT型的胸肌IMF、胸肌嫩度和腿肌嫩度值均高于CC型和CT型,公鸭的胸肌IMF含量和腿肌嫩度显著高于母鸭(P<0,05)。基因A-FABP各基因型的表达量无显著差异(P>0.05),BB型和BD型的胸肌嫩度和腿肌嫩度极显著高于DD型(P<0.01),但BB型和BD型之间无显著差异(P>0.05);母鸭的胸肌嫩度显著高于公鸭(P<0.05)。各基因型和性别在CYP7A1基因的胸肌IMF、腿肌IMF、胸肌嫩度、腿肌嫩度、胸肌率、腿肌率指标以及表达量上无显著差异(P>0.05)。研究结果显示,ApoVLDL-Ⅱ和A-FABP基因可作为巢湖鸭肉质性状选育的候选基因。
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