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肌肉生长与肌肉品质性状的改良一直是家畜育种工作的主要目标之一，二者均属于多基因控制的数量性状。不同猪种尤其是中国地方猪种与外国引进猪种在肌肉生长和肉质性状上表现着极大的差异。骨骼肌组织的基因表达在决定肌肉生长和肌肉品质方面起着非常重要的作用。为了初步了解造成中外猪种在上述性状上表型差异的遗传本质，本研究利用mRNA差异显示技术和cDNA宏阵列分析技术对中外猪种中两个代表品种—杜洛克和二花脸成年猪眼肌组织的总RNA进行了比较分析，此外，为了克隆可能与肌肉生长相关的侯选基因，还采用cDNA末端快速扩增和电脑克隆的方法获得了一个在不同生长发育阶段差异表达的新表达序列标签(EST)的全长cDNA。主要研究结果如下： 1．经过大量的摸索，对mRNA差异显示的相关技术条件进行了优化，建立了一套银染差异显示的技术。共使用了5种锚定引物和20种随机引物共100种组合对两品种成年猪眼肌组织总RNA进行了差异显示研究，检测了近5000条cDNA带，发现其中22条为可重复的差异显示EST(ESThp1、ESThp2…ESThp22)，其中4条在杜洛克品种猪表达量比二花脸品种猪高，其他18条在二花脸品种猪中表达量比在杜洛克品种猪高。将22条差异显示的EST全部回收、重扩增、克隆和测序，得到的序列与GenBank中的序列进行同源性比对后发现其中4个EST(ESThp1、ESThp3、ESThp9-1和ESThp15)在GenBank中无同源性，将这些EST提交GenBank，其登录号为BI596262-BI596265。其他的EST分别与猪的肌球蛋白重链mRNA(myosin heavy chain mRNA，MyHC)、NADH氧化脱氢酶亚基2(NADH dehydrogenase subunit 2，NADH2)、NADH氧化脱氢酶亚基4(NADH dehydrogenase subunit 4，NADH4)、细胞色素氧化酶亚基2(cytochrome coxidase subunit Ⅱ，Co Ⅱ)、12S rRNA、16S rRNA、腺苷三磷酸酶亚基6(ATPase subunit 6，ATPase 6)和磷酸甘油酸激酶亚基1(phosphoglycerate kinase subunit 1，PGK-1)高度同源。由于存在几个由不同引物组合产生的EST与同一个猪的cDNA同源的现象，所以22条EST实际上代表了12个猪的cDNA。利用反Northern blot和Northern blot验证了ESThp1和猪NADH2基因在两品种间的表达差异达到显著(P＜0.05)和极显著水平(P＜0.01)。采用半定量RT-PCR研究了两个新的EST(ESThp1和ESThp9-1)在猪主要组织中的表达分布，其中ESThp1仅在猪的心脏和骨骼肌组织中表达，ESThp9-1在猪的各主要组织中均有表达。利用体细胞杂种板和辐射杂种板技术将ESThp9-1定位于猪12号染色体长臂(Sscr12q1.1-1.5)，与微卫星位点S0090连锁，LOD值为11.86。 2．对cDNA宏阵列分析技术的各种实验条件进行了摸索，采用含327个来源于猪胚胎文库和成年猪骨骼肌文库的EST的宏阵列尼龙膜对杜洛克和二花脸成年猪眼肌组织总RNA进行了比较研究，结果表明这327个EST在两品种间无显著表达差异。 3．采用cDNA末端快速扩增方法获得了一个在猪不同生长发育阶段骨骼肌中差异表达的新 EST M223（GenBank登录号：AA063663）的 3’端序列，接着利用电脑克隆的方法克隆了其全长山NA并对之进行了实验验证。该CDNA全长3901hp，含有一个典型的550aa的开放阅读框架、3 17hp的了 一翻译区（nranslatingregion，UTR）、1902hp的3‘UTR和 32个 A的多聚腺首尾，与人的一个未命名蛋白 XM072203部分同源。半定量RTPCR分析显示其在猪心脏和骨骼肌组织中表达丰富。体细胞杂种板和辐射杂种板分析将其定位于猪15号染色体长臂侣．5毛．2人与微卫星位点50080连锁，LOD值为 12刀1。 本研究有助于对中外猪种生长、胭体和肉质性状差异形成原因的分子基础的认识，为猪基因组的研究增加了新的资料。